19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0962 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0962  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  253  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0959  hypothetical protein  95.24 
 
 
130 aa  200  6e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0909  hypothetical protein  86.14 
 
 
130 aa  161  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0615  hypothetical protein  35.8 
 
 
148 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00186832  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1744  cytochrome c family protein  36.9 
 
 
337 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.740978 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0959  multiheme cytochrome  41.18 
 
 
447 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0953  hydroxylamine oxidase  39.68 
 
 
442 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0956  multihaem cytochrome  41.18 
 
 
446 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3025  hypothetical protein  32.05 
 
 
489 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0800  hydroxylamine oxidase  34.09 
 
 
461 aa  44.7  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000654333  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0467  hydroxylamine oxidase  35.53 
 
 
464 aa  43.9  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0300  hypothetical protein  33.72 
 
 
461 aa  43.5  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  36.36 
 
 
337 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  35.44 
 
 
1294 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1628  hypothetical protein  34.21 
 
 
436 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975742  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1552  beta ketoacyl-acyl carrier protein synthase II  24.79 
 
 
456 aa  42  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2381  cytochrome C family protein  28.57 
 
 
315 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.300688  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0983  hypothetical protein  32 
 
 
425 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.392669 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  35.71 
 
 
884 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>