17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0533 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0533  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  452  1.0000000000000001e-126  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.738429  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0527  hypothetical protein  79.39 
 
 
231 aa  329  2e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.810163 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2689  hypothetical protein  43.09 
 
 
207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2045  hypothetical protein  35.71 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00025846  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0580  hypothetical protein  37.75 
 
 
195 aa  98.6  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000209593  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2540  hypothetical protein  39.35 
 
 
194 aa  90.1  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  32.14 
 
 
596 aa  46.6  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  26.56 
 
 
589 aa  46.6  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2550  hydroxylamine oxidase  27.46 
 
 
511 aa  46.2  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0946  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  38.36 
 
 
122 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1004  hypothetical protein  27.32 
 
 
165 aa  42.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04270  hypothetical protein  28.57 
 
 
182 aa  43.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.379993  normal  0.356103 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1445  flavocytochrome c heme subunit  27.07 
 
 
153 aa  42.4  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0942  hypothetical protein  28.26 
 
 
172 aa  42.4  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  30.36 
 
 
596 aa  42.4  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3693  hypothetical protein  29.41 
 
 
118 aa  42  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.799168  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  38.36 
 
 
596 aa  41.6  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>