142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3521 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3521  YceI family protein  100 
 
 
221 aa  422  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.761218  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3289  YceI family protein  61 
 
 
236 aa  216  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2124  YceI family protein  48.58 
 
 
246 aa  179  4e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.97033 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0400  hypothetical protein  54.44 
 
 
246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00289936  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28440  hypothetical protein  50 
 
 
229 aa  154  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.533417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0734  YceI family protein  43.09 
 
 
241 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2969  YceI family protein  35.15 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0535  YceI family protein  28.31 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3479  YceI family protein  30.21 
 
 
269 aa  65.5  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.482205 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0918  YceI family protein  31.25 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0504  YceI family protein  27.54 
 
 
267 aa  58.5  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0863373  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  31.36 
 
 
196 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0502  YceI family protein  28.51 
 
 
260 aa  57  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000406201  decreased coverage  0.00000051699 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  28.69 
 
 
191 aa  55.8  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4329  YceI family protein  29.51 
 
 
200 aa  55.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.969804  normal  0.149474 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  34.48 
 
 
223 aa  55.1  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  39.13 
 
 
178 aa  54.7  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  29.05 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  36.7 
 
 
187 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  33.62 
 
 
201 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  33.62 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  32.32 
 
 
193 aa  52.8  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  29.22 
 
 
197 aa  52.8  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  36.75 
 
 
212 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1380  YceI family protein  36.89 
 
 
187 aa  52.4  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181422  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  32.93 
 
 
209 aa  52.4  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  28 
 
 
189 aa  52.4  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  32.46 
 
 
183 aa  52  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  41.12 
 
 
183 aa  52  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  26.83 
 
 
196 aa  50.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  38.78 
 
 
183 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  29.37 
 
 
186 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  29.37 
 
 
192 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0433  YceI family protein  36.36 
 
 
202 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0486569  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  36.96 
 
 
174 aa  50.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  31.87 
 
 
199 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  33.33 
 
 
181 aa  50.1  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  29.73 
 
 
201 aa  50.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0469  hypothetical protein  29.49 
 
 
190 aa  49.7  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.189395  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  31.71 
 
 
191 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  32.17 
 
 
195 aa  49.7  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2851  YceI family protein  33.33 
 
 
203 aa  49.7  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344848  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0167  hypothetical protein  26.21 
 
 
181 aa  48.9  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  33.33 
 
 
180 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  31.62 
 
 
182 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  36 
 
 
192 aa  49.3  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37090  hypothetical protein  40 
 
 
172 aa  49.3  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0651495  normal  0.0184068 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  29.89 
 
 
177 aa  48.9  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2155  two component regulator propeller domain protein  28.87 
 
 
534 aa  48.9  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235717 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  28.93 
 
 
201 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  32.45 
 
 
182 aa  48.5  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  35.44 
 
 
204 aa  48.5  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  27.78 
 
 
190 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0195  YceI family protein  31.96 
 
 
187 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  30.89 
 
 
191 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  27.78 
 
 
191 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  33.33 
 
 
191 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  33.33 
 
 
191 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  28.38 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  33.33 
 
 
191 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  33.33 
 
 
191 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  37.76 
 
 
183 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  36.26 
 
 
184 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  26.27 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  31.58 
 
 
195 aa  47.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  28.57 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  30.52 
 
 
177 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  28.44 
 
 
198 aa  46.6  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  36.97 
 
 
189 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  34.45 
 
 
183 aa  46.6  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  32.21 
 
 
181 aa  46.2  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  27.27 
 
 
201 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  31.97 
 
 
185 aa  46.2  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3996  hypothetical protein  24.29 
 
 
184 aa  46.2  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  27.78 
 
 
191 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  36.73 
 
 
183 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  35.8 
 
 
199 aa  46.2  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  27.78 
 
 
191 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  27.78 
 
 
191 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0443  hypothetical protein  26.92 
 
 
190 aa  45.8  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  26.53 
 
 
189 aa  45.8  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  28.97 
 
 
182 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  27.78 
 
 
191 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  27.78 
 
 
191 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  27.78 
 
 
191 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  27.78 
 
 
191 aa  45.8  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  27.78 
 
 
191 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  27.78 
 
 
191 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  31.36 
 
 
188 aa  45.4  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24290  hypothetical protein  41.11 
 
 
176 aa  45.1  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0570577  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2890  hypothetical protein  22.13 
 
 
189 aa  45.1  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  26.85 
 
 
188 aa  44.7  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3041  hypothetical protein  27.55 
 
 
191 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000749458  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  32.32 
 
 
182 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1536  hypothetical protein  28.36 
 
 
190 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  32.32 
 
 
182 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  28.26 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  26.23 
 
 
189 aa  43.5  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  25.25 
 
 
189 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3198  hypothetical protein  27.55 
 
 
191 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  normal  0.576975 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>