More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2885 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2885  YceI family protein  100 
 
 
229 aa  465  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.265419  normal  0.0897618 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3033  YceI family protein  53.46 
 
 
224 aa  230  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  48.37 
 
 
187 aa  189  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0195  YceI family protein  46.7 
 
 
187 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  41.38 
 
 
183 aa  148  8e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4591  YceI family protein  40.69 
 
 
190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  37.9 
 
 
219 aa  141  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  40.5 
 
 
181 aa  141  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  38.32 
 
 
181 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  38.24 
 
 
180 aa  138  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  37.56 
 
 
181 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  39.22 
 
 
186 aa  137  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  39.02 
 
 
189 aa  137  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  38.24 
 
 
183 aa  135  5e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07170  hypothetical protein  39.51 
 
 
181 aa  132  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24290  hypothetical protein  38.81 
 
 
176 aa  131  9e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0570577  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  37.25 
 
 
181 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  36.55 
 
 
182 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  39.22 
 
 
182 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  39.8 
 
 
175 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  37.06 
 
 
182 aa  128  9.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  34.15 
 
 
187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  35.5 
 
 
177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  38.54 
 
 
182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  39.51 
 
 
196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  38.81 
 
 
187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  35.61 
 
 
183 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0441  YceI family protein  38.73 
 
 
183 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.886129  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  41.18 
 
 
183 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  35.89 
 
 
194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  41.18 
 
 
183 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  41.79 
 
 
183 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  37.13 
 
 
185 aa  124  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  38.69 
 
 
182 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  36.41 
 
 
175 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  37.25 
 
 
182 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  38.92 
 
 
199 aa  122  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  39.3 
 
 
188 aa  122  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2737  YceI family protein  36.97 
 
 
181 aa  122  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0292655  normal  0.091865 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  34.45 
 
 
178 aa  121  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  38.94 
 
 
200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  36.63 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  34.98 
 
 
186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  37.86 
 
 
201 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0518  YceI family protein  37.37 
 
 
181 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000120674  hitchhiker  0.000476131 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  36.76 
 
 
182 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  36.76 
 
 
182 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  36.76 
 
 
182 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  35.92 
 
 
196 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  38.42 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  37.93 
 
 
201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  35.92 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  38.31 
 
 
183 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  37.32 
 
 
182 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  35.78 
 
 
181 aa  115  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  37.44 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  30.89 
 
 
174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  34.12 
 
 
214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  36.95 
 
 
201 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  36.36 
 
 
212 aa  111  9e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  32.31 
 
 
195 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  36.14 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  33.66 
 
 
177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  36.14 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  35.61 
 
 
195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  35.61 
 
 
182 aa  109  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  36.27 
 
 
181 aa  109  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  35.64 
 
 
201 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  33.33 
 
 
182 aa  108  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  34.4 
 
 
198 aa  107  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  34.93 
 
 
197 aa  105  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  30.77 
 
 
176 aa  105  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1380  YceI family protein  33.01 
 
 
187 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181422  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  34.45 
 
 
197 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  34.36 
 
 
204 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  34.17 
 
 
184 aa  101  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  32.49 
 
 
177 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  29.81 
 
 
182 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  31.03 
 
 
182 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7583  YceI-like family protein  33.65 
 
 
202 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.94246  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  30.09 
 
 
285 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  31.4 
 
 
180 aa  99.8  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  30.26 
 
 
178 aa  99.4  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2032  YceI  26.34 
 
 
192 aa  97.4  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.267829  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2314  hypothetical protein  31.5 
 
 
171 aa  94.7  9e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.613001  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2685  YceI family protein  29.06 
 
 
174 aa  94.4  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1960  hypothetical protein  35.1 
 
 
196 aa  93.6  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3701  YceI  32.02 
 
 
187 aa  92.8  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  33 
 
 
191 aa  92.4  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  27.09 
 
 
175 aa  91.7  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  28.86 
 
 
175 aa  91.3  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0268  hypothetical protein  33.83 
 
 
232 aa  89.4  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1711  YceI family protein  29.85 
 
 
188 aa  89.4  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2711  hypothetical protein  29.5 
 
 
171 aa  89  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.440921  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2768  hypothetical protein  29.5 
 
 
171 aa  89  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000157098  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3656  YceI family protein  26.8 
 
 
180 aa  88.6  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  33.33 
 
 
195 aa  88.2  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  32.02 
 
 
179 aa  87  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  29.7 
 
 
179 aa  86.3  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  32.78 
 
 
196 aa  85.5  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>