130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0326 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0326  YceI family protein  100 
 
 		 181 aa  347  4e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  32.61 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  30.77 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  30.77 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  30.77 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  28 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  31.28 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  25.88 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  26.47 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  27.08 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  23.08 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37090  hypothetical protein  30 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0651495  normal  0.0184068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  30.37 
 
 		 212 aa  64.3  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  25.84 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  30.11 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  29.05 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1380  YceI family protein  34.15 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181422  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  27.98 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  26.83 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0518  YceI family protein  30.81 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000120674  hitchhiker  0.000476131 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  24.11 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0441  YceI family protein  29.31 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.886129  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  30 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  26.44 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  25 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  30.17 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  30.33 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  29.59 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  27.82 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  26.16 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  29.03 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  29.32 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  25.15 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2737  YceI family protein  29.92 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0292655  normal  0.091865 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  24.79 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3656  YceI family protein  25.52 
 
 		 180 aa  57  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  30.33 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  29.83 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7583  YceI-like family protein  27.47 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.94246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  26.79 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  30.06 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  24.26 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07170  hypothetical protein  29.91 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  23.61 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  24.4 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  27.68 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  32 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3701  YceI  28.79 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  27.78 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  30.56 
 
 		 201 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0195  YceI family protein  27.06 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2435  YceI family protein  28.99 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.832405  normal  0.0582212 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  28.74 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  27.46 
 
 		 195 aa  52.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  29.86 
 
 		 223 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  25.14 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  28.23 
 
 		 198 aa  52.4  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  25.4 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  25.77 
 
 		 175 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  28.7 
 
 		 285 aa  52.4  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  28.57 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24290  hypothetical protein  32.52 
 
 		 176 aa  52.4  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0570577  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  29.17 
 
 		 201 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  29.01 
 
 		 189 aa  51.6  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0172  hypothetical protein  27.89 
 
 		 190 aa  51.6  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2032  YceI  22.4 
 
 		 192 aa  51.2  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.267829  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  25.28 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  31.58 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  24.79 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  27.4 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  30.68 
 
 		 197 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  30.68 
 
 		 197 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  26.55 
 
 		 186 aa  49.3  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  29.17 
 
 		 214 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4591  YceI family protein  23.73 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  25.48 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  28.95 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  28.12 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0268  hypothetical protein  29.91 
 
 		 232 aa  48.1  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  27.78 
 
 		 175 aa  48.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  26.8 
 
 		 202 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  23.78 
 
 		 177 aa  47.8  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  26.19 
 
 		 204 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  28.95 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  24.83 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  30.56 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  36.08 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  27.49 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  25 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  24.4 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  24.43 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  30.99 
 
 		 192 aa  45.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  30.99 
 
 		 192 aa  45.8  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  30.99 
 
 		 192 aa  45.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  25 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  28.95 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  30.43 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0950  hypothetical protein  25.64 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000269923  normal  0.477847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1196  YceI family protein  30.39 
 
 		 183 aa  45.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00341988  normal  0.225217 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  24.44 
 
 		 192 aa  45.1  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>