More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4157 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4157  YceI family protein  100 
 
 		 202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0268  hypothetical protein  64.55 
 
 		 232 aa  258  4e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  37.1 
 
 		 183 aa  123  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  38.3 
 
 		 194 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  37.43 
 
 		 200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  39.04 
 
 		 186 aa  115  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  39.08 
 
 		 181 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  37.29 
 
 		 180 aa  114  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  39.08 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  39.08 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  37.37 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  39.64 
 
 		 183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  35.59 
 
 		 180 aa  112  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  37.93 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  37.78 
 
 		 285 aa  108  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  36.81 
 
 		 214 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  35.75 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  38.17 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  35.75 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  35.75 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  37.7 
 
 		 181 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  36.87 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  39.66 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  35.91 
 
 		 187 aa  106  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  35.36 
 
 		 182 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  34.48 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  36.51 
 
 		 187 aa  105  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  37.22 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  35.03 
 
 		 182 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7583  YceI-like family protein  37.08 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.94246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  35.39 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  35.96 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  37.77 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  34.94 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  36.87 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  36.42 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  34.46 
 
 		 182 aa  101  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1380  YceI family protein  36.41 
 
 		 187 aa  101  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181422  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  36.26 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  33.89 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4591  YceI family protein  34.62 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  35.2 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  35.2 
 
 		 201 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  35.2 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  34.05 
 
 		 183 aa  99.8  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  35.67 
 
 		 182 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  33.89 
 
 		 197 aa  99  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  34.64 
 
 		 201 aa  99  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  35.2 
 
 		 201 aa  98.6  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  34.88 
 
 		 182 aa  98.6  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  34.9 
 
 		 181 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24290  hypothetical protein  37.14 
 
 		 176 aa  98.2  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0570577  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  34.09 
 
 		 183 aa  98.2  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  34.66 
 
 		 183 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  33.16 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  34.3 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07170  hypothetical protein  35.84 
 
 		 181 aa  96.3  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  33.7 
 
 		 181 aa  96.3  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  38.15 
 
 		 186 aa  96.3  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  35.47 
 
 		 193 aa  95.9  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0441  YceI family protein  35.96 
 
 		 183 aa  95.9  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.886129  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  34.88 
 
 		 182 aa  95.9  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0195  YceI family protein  35.06 
 
 		 187 aa  95.5  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  35.93 
 
 		 189 aa  95.1  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2737  YceI family protein  36.93 
 
 		 181 aa  94  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0292655  normal  0.091865 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  34.41 
 
 		 209 aa  93.2  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  35.75 
 
 		 216 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  34.74 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  35.12 
 
 		 178 aa  92.4  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0518  YceI family protein  32.95 
 
 		 181 aa  92.4  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000120674  hitchhiker  0.000476131 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  33.14 
 
 		 174 aa  92.4  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1960  hypothetical protein  36.31 
 
 		 196 aa  91.7  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  32.39 
 
 		 213 aa  91.7  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  32.39 
 
 		 213 aa  91.7  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  32.75 
 
 		 184 aa  91.3  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  32.4 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  32.56 
 
 		 181 aa  90.9  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  36.72 
 
 		 195 aa  89.4  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  38.61 
 
 		 201 aa  89.4  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  33.7 
 
 		 196 aa  89  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2435  YceI family protein  41.27 
 
 		 188 aa  88.6  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.832405  normal  0.0582212 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  34.08 
 
 		 216 aa  88.2  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  32.78 
 
 		 201 aa  88.2  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  29.55 
 
 		 175 aa  87.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  37.06 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  32.2 
 
 		 176 aa  87.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  34.57 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  34 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  36.73 
 
 		 179 aa  87  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3701  YceI  34.48 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3033  YceI family protein  33.83 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  31.82 
 
 		 179 aa  86.3  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  33.53 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  32.02 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4488  YceI family protein  34.36 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.644863  normal  0.336697 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  33.72 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  30.81 
 
 		 177 aa  84.3  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  30.34 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  31.25 
 
 		 182 aa  84.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  33.53 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>