More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01687 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01687  YceI like family  100 
 
 		 189 aa  376  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.740504  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3045  YceI family protein  76.79 
 
 		 190 aa  250  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0685  hypothetical protein  64.67 
 
 		 189 aa  248  5e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0602  YceI family protein  63.04 
 
 		 189 aa  244  4e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  41.29 
 
 		 421 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3153  YceI  31.64 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0885591  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1030  hypothetical protein  36.6 
 
 		 186 aa  99.4  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.103898  normal  0.0258647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  36.02 
 
 		 441 aa  96.7  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1616  hypothetical protein  31.84 
 
 		 191 aa  94.7  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  33.69 
 
 		 190 aa  94.7  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  35.48 
 
 		 188 aa  94.4  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3540  YceI  32.04 
 
 		 185 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1611  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  92.4  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  34.01 
 
 		 420 aa  90.9  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  34.19 
 
 		 194 aa  90.9  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1027  YceI family protein  34.19 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0470  YceI family protein  31.58 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  35.56 
 
 		 192 aa  85.5  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  31.18 
 
 		 191 aa  84.7  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  36.36 
 
 		 416 aa  82.4  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  29.94 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5251  YceI family protein  38.57 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4402  YceI family protein  33.74 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  33.12 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2321  YceI  35.07 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3579  YceI family protein  31.61 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.948947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  34.13 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  28.73 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2962  YceI family protein  30.63 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2552  YceI family protein  31.67 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370741  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  29.67 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1860  YceI family protein  28.75 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2227  YceI family protein  30.26 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000482548  decreased coverage  0.00464038 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2795  YceI  31.95 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  33.13 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  28.65 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  37.07 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  33.61 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  36.23 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  29.05 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  36.23 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  36.23 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  29.52 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  27.6 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  34.15 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  32 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1520  YceI family protein  27.08 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  28 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  32.43 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  27.06 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3331  YceI family protein  29.82 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.634515  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  42.05 
 
 		 183 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  31.25 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  31.67 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0832  YceI family protein  28.57 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.261869  hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  40.91 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0950  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000269923  normal  0.477847 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  36.44 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2890  hypothetical protein  34.48 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  32.69 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  32.69 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  29.51 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3198  hypothetical protein  32.17 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  28.47 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  35.61 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  28.22 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3041  hypothetical protein  32.33 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000749458  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  35.61 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  35.61 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  35.61 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  35.61 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  35.61 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  35.61 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  30.94 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  35.61 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  35.61 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2314  YceI family protein  30.67 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0834  YceI family protein  31.54 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.929023  hitchhiker  0.00225936 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  27.56 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0332  YceI family protein  27.27 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  35.29 
 
 		 209 aa  62  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3055  hypothetical protein  32.33 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011163  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  32.33 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  28.72 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  29.41 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  33.73 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  32.5 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  35.29 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  33.6 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  33.33 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  38.64 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  29.81 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1178  hypothetical protein  31.82 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000879388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1179  hypothetical protein  31.82 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000115477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  30 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  31.16 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  31.16 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  31.16 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  29.17 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  30.3 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>