More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0602 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0602  YceI family protein  100 
 
 		 189 aa  388  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0685  hypothetical protein  97.88 
 
 		 189 aa  378  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01687  YceI like family  63.04 
 
 		 189 aa  244  4e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.740504  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3045  YceI family protein  67.26 
 
 		 190 aa  235  4e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  37.66 
 
 		 421 aa  114  7.999999999999999e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  36.76 
 
 		 420 aa  100  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  36.02 
 
 		 441 aa  99.8  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1030  hypothetical protein  34 
 
 		 186 aa  95.5  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.103898  normal  0.0258647 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  34.16 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3153  YceI  27.22 
 
 		 183 aa  92.4  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0885591  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  34.84 
 
 		 188 aa  91.7  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3540  YceI  31.58 
 
 		 185 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5251  YceI family protein  37.14 
 
 		 192 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1616  hypothetical protein  30.39 
 
 		 191 aa  87.8  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4402  YceI family protein  32.9 
 
 		 190 aa  87.8  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  32.26 
 
 		 194 aa  87.8  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1611  hypothetical protein  32.45 
 
 		 191 aa  87.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0470  YceI family protein  30.43 
 
 		 193 aa  86.3  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2321  YceI  33.81 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  29.94 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2795  YceI  31.93 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  30.23 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1860  YceI family protein  28.75 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  28.81 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  31.45 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  34.06 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1027  YceI family protein  32.26 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2227  YceI family protein  29.61 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000482548  decreased coverage  0.00464038 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  26.67 
 
 		 416 aa  74.7  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2314  YceI family protein  34.88 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  32.12 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  34.27 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  30.18 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  29.85 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  33.33 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  34.43 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  32.23 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  33.33 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  29.45 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  32.5 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1520  YceI family protein  21.88 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  29.73 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3579  YceI family protein  27.1 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.948947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  30.2 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  33.63 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  31.16 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  33.33 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  34.06 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  31.75 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  31.71 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  25 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  32.5 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  27.48 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  29.24 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  30.83 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2962  YceI family protein  26.09 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  33.06 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  24.36 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  34.51 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  30.53 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  27.48 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  30 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  29.75 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4649  YceI family protein  32.06 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.270217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  32.5 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  32.54 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  28.33 
 
 		 182 aa  62  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  30.83 
 
 		 189 aa  62  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  27.5 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  26.72 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  30.71 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  23.94 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  25 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  37.5 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  29.29 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2552  YceI family protein  23.91 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370741  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  32.23 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  31.45 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  32.14 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  26.72 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  34.71 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  32.14 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  26.72 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  28.93 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1196  YceI family protein  28.79 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00341988  normal  0.225217 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  23.53 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  32.06 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  35.23 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  28.22 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  23.08 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  26.83 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  31.82 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1217  hypothetical protein  30.99 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000670198  normal  0.302127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  28.93 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  22.79 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  30.83 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  28.93 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  23.75 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  23.75 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>