45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_56510 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_56510  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  388  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.844348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4915  hypothetical protein  97.45 
 
 		 195 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4910  hypothetical protein  42.02 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.372677  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1183  YceI family protein  38.3 
 
 		 195 aa  137  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.123234  normal  0.710564 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4460  YceI family protein  43.53 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111755 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1295  YceI  42.01 
 
 		 196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.018481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0930  YceI family protein  41.76 
 
 		 193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0994  YceI family protein  42.6 
 
 		 193 aa  131  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000032385 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0891  YceI family protein  41.42 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56420  hypothetical protein  39.89 
 
 		 190 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1628  YceI family protein  36.26 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.390594  normal  0.0802652 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4045  YceI  36.41 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.033044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1704  YceI family protein  33.53 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1131  YceI family protein  40.59 
 
 		 208 aa  125  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2893  hypothetical protein  35.16 
 
 		 191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1561  YceI family protein  34.62 
 
 		 191 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1636  YceI family protein  34.62 
 
 		 191 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.431474  normal  0.0372178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4350  YceI-like family protein  35.87 
 
 		 193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1809  YceI family protein  31.52 
 
 		 191 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.712609  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1772  YceI family protein  31.52 
 
 		 191 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1959  hypothetical protein  31.49 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1651  YceI family protein  30.22 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2513  YceI family protein  31.52 
 
 		 191 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1765  YceI family protein  31.52 
 
 		 191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2605  YceI family protein  30.43 
 
 		 191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.911496 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  35.59 
 
 		 1042 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2223  YceI family protein  30.65 
 
 		 195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.128547  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2275  YceI  33.33 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000110231  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2476  YceI family protein  27.01 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00617169  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1182  hypothetical protein  34.88 
 
 		 371 aa  107  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.104267 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03973  YceI family protein  31.03 
 
 		 194 aa  105  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000954749  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0136  YceI  29.84 
 
 		 198 aa  99.8  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1355  YceI  30.16 
 
 		 193 aa  97.1  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2061  YceI family protein  27.03 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3983  YceI family protein  24.87 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05610  hypothetical protein  25.58 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  24.44 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  28.12 
 
 		 201 aa  44.7  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1026  YceI family protein  30.59 
 
 		 225 aa  44.7  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  25 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  22.95 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1058  hypothetical protein  27.52 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0067  YceI family protein  26.5 
 
 		 171 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  28.87 
 
 		 421 aa  42.7  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1030  hypothetical protein  32.81 
 
 		 186 aa  41.2  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.103898  normal  0.0258647 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>