38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3103 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3103  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  390  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1395  YceI family protein  25 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.187267  normal  0.0429317 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2969  YceI family protein  24.35 
 
 
195 aa  54.7  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2321  YceI  30.58 
 
 
191 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2164  YceI family protein  24.32 
 
 
177 aa  53.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0504  YceI family protein  32.48 
 
 
267 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0863373  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3153  YceI  27.1 
 
 
183 aa  51.6  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0885591  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  29.8 
 
 
205 aa  51.6  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0734  YceI family protein  26.17 
 
 
241 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  32.05 
 
 
193 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0535  YceI family protein  23.72 
 
 
223 aa  47.4  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  29.29 
 
 
186 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  33.33 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  24.02 
 
 
416 aa  46.6  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  30.58 
 
 
186 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  30.58 
 
 
186 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  30.58 
 
 
186 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  33.6 
 
 
206 aa  45.4  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  30.58 
 
 
186 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0457  YceI family protein  26.45 
 
 
189 aa  45.1  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  27.39 
 
 
191 aa  43.9  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  26.6 
 
 
199 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  25 
 
 
178 aa  43.5  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  29.32 
 
 
187 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  29.61 
 
 
191 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  26.8 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  28.57 
 
 
187 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  28.78 
 
 
192 aa  42.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  25.41 
 
 
178 aa  42.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3300  YceI family protein  24.58 
 
 
186 aa  42  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.607855 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2124  YceI family protein  27.18 
 
 
246 aa  42  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.97033 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  29.32 
 
 
191 aa  42  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1027  YceI family protein  29.46 
 
 
193 aa  41.6  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0469  hypothetical protein  29.75 
 
 
190 aa  41.2  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.189395  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0432  YceI family protein  27.93 
 
 
198 aa  41.2  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.115751  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  29.6 
 
 
209 aa  41.2  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1295  YceI  29.76 
 
 
196 aa  41.2  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.018481  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0606  YceI family protein  31.13 
 
 
186 aa  41.2  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>