More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1495 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1495  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 2478 aa  4922    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.49 
 
 		 3038 aa  323  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  42.25 
 
 		 2537 aa  177  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0747  outer membrane adhesin like proteiin  31.13 
 
 		 1598 aa  154  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525894 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  28.34 
 
 		 2452 aa  140  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  30.97 
 
 		 1867 aa  130  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1665  outer membrane adhesin like proteiin  34.38 
 
 		 2825 aa  129  6e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1666  von Willebrand factor type A  28.51 
 
 		 1232 aa  124  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.854406  normal  0.168302 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  29.46 
 
 		 2127 aa  120  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0782  von Willebrand factor type A  30.75 
 
 		 5009 aa  106  7e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1662  von Willebrand factor type A  31.2 
 
 		 6006 aa  103  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.81 
 
 		 2812 aa  99.8  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  50.94 
 
 		 4106 aa  99  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  42.53 
 
 		 1166 aa  99.4  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  48.04 
 
 		 2704 aa  97.8  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  38.73 
 
 		 8321 aa  95.1  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  48.51 
 
 		 5218 aa  93.2  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  36.69 
 
 		 6753 aa  92  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  45 
 
 		 8682 aa  91.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  45 
 
 		 9030 aa  91.3  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  52.13 
 
 		 5962 aa  91.7  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  50 
 
 		 2542 aa  90.1  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.22 
 
 		 4220 aa  89  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.19 
 
 		 4836 aa  87.8  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  48.94 
 
 		 4678 aa  87.4  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.17 
 
 		 2239 aa  86.7  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  33.17 
 
 		 6779 aa  86.3  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  47.96 
 
 		 3314 aa  86.3  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  33.17 
 
 		 6662 aa  85.9  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  35.78 
 
 		 1699 aa  85.9  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.17 
 
 		 6683 aa  85.9  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.41 
 
 		 2678 aa  85.9  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  44.76 
 
 		 417 aa  84  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  46.94 
 
 		 686 aa  83.2  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  41.46 
 
 		 2251 aa  82.8  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  44.23 
 
 		 16322 aa  82.4  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  42.73 
 
 		 2296 aa  81.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  39.87 
 
 		 3184 aa  81.3  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 		 5171 aa  81.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  44.08 
 
 		 1883 aa  80.1  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  38.46 
 
 		 542 aa  80.1  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  42.64 
 
 		 556 aa  79  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  33.84 
 
 		 3229 aa  79  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.36 
 
 		 485 aa  77.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3576  hemolysin-type calcium-binding region  52.58 
 
 		 547 aa  77.8  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  38.96 
 
 		 219 aa  77.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  50.56 
 
 		 329 aa  78.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  48.91 
 
 		 219 aa  78.2  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  50.56 
 
 		 329 aa  78.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  46.59 
 
 		 4791 aa  77.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  43.48 
 
 		 460 aa  77.8  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.42 
 
 		 5787 aa  77.4  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  36.42 
 
 		 1202 aa  77.4  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  49.44 
 
 		 561 aa  77  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 		 589 aa  77  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2337  hypothetical protein  36.22 
 
 		 1035 aa  77.4  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  53.85 
 
 		 7149 aa  77  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  45.26 
 
 		 1538 aa  76.3  0.000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  51.58 
 
 		 518 aa  76.3  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.12 
 
 		 2668 aa  76.3  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.11 
 
 		 1016 aa  76.3  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  41.28 
 
 		 980 aa  75.9  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  43.97 
 
 		 2768 aa  75.9  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.64 
 
 		 5839 aa  75.5  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  38.3 
 
 		 686 aa  75.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  42.14 
 
 		 2336 aa  75.9  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  47.06 
 
 		 303 aa  75.1  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  48.51 
 
 		 1164 aa  75.5  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  34.5 
 
 		 1499 aa  75.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  32.5 
 
 		 4854 aa  74.7  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  51.72 
 
 		 363 aa  74.7  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  36.36 
 
 		 5442 aa  74.7  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  46.02 
 
 		 855 aa  73.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  32.98 
 
 		 2743 aa  73.9  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  44.44 
 
 		 1306 aa  73.6  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  44.23 
 
 		 867 aa  73.6  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  40.98 
 
 		 341 aa  72.4  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  40.98 
 
 		 341 aa  72  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  43.48 
 
 		 1279 aa  72.4  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  43.12 
 
 		 460 aa  72.4  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1796  hemolysin-type calcium-binding region  34.5 
 
 		 537 aa  72  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.47796  hitchhiker  0.00183267 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  44.12 
 
 		 2105 aa  71.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  47.31 
 
 		 686 aa  71.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  40.94 
 
 		 1019 aa  71.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0412  beta-Ig-H3/fasciclin  42.19 
 
 		 510 aa  71.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.821212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.42 
 
 		 2346 aa  71.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  52.56 
 
 		 424 aa  71.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  35.71 
 
 		 3091 aa  71.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  37.09 
 
 		 4285 aa  72  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  42.86 
 
 		 615 aa  71.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  47 
 
 		 467 aa  70.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  34.97 
 
 		 4798 aa  70.9  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  45.68 
 
 		 3598 aa  70.9  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3878  lipase  37.39 
 
 		 709 aa  71.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0292806 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.17 
 
 		 4122 aa  70.5  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  48.05 
 
 		 769 aa  70.5  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  49.53 
 
 		 1480 aa  70.5  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  48.78 
 
 		 2567 aa  70.1  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  55.88 
 
 		 1963 aa  70.1  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.24 
 
 		 5098 aa  70.1  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>