13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2514 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2514  hypothetical protein  100 
 
 		 1338 aa  2616    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.482262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3319  structural toxin protein RtxA  35.92 
 
 		 2159 aa  319  3e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  40.4 
 
 		 7919 aa  213  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  38.19 
 
 		 1806 aa  205  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  35.1 
 
 		 7679 aa  203  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  38.05 
 
 		 1350 aa  197  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1278  hypothetical protein  64.29 
 
 		 572 aa  156  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1277  hypothetical protein  31.38 
 
 		 479 aa  123  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.739911  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  28.9 
 
 		 2452 aa  115  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  40.7 
 
 		 2336 aa  85.5  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  33.9 
 
 		 5171 aa  61.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  25.83 
 
 		 3184 aa  53.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000324  autotransporter adhesin  25.92 
 
 		 5123 aa  47.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>