44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2759 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2759  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  727    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7055  hypothetical protein  34.72 
 
 		 356 aa  206  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0582367  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1160  hypothetical protein  37.91 
 
 		 356 aa  184  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.860855 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3186  hypothetical protein  31.34 
 
 		 335 aa  157  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1192  hypothetical protein  31.73 
 
 		 447 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7560  hypothetical protein  30.64 
 
 		 348 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2438  Protein of unknown function DUF2169  34.73 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2334  hypothetical protein  33.75 
 
 		 370 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00524729  normal  0.0110062 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0291  hypothetical protein  31.64 
 
 		 337 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4073  hypothetical protein  34.19 
 
 		 373 aa  139  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125532 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01180  hypothetical protein  31.88 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.176675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0171  hypothetical protein  31.88 
 
 		 370 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0538  hypothetical protein  33.86 
 
 		 373 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2128  hypothetical protein  29.47 
 
 		 438 aa  124  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3869  hypothetical protein  29.87 
 
 		 438 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0106797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3467  hypothetical protein  31.94 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3112  hypothetical protein  31.94 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192331  normal  0.139244 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2439  hypothetical protein  28.9 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646599  normal  0.310656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4428  hypothetical protein  26.88 
 
 		 445 aa  96.3  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3387  hypothetical protein  31.14 
 
 		 338 aa  95.9  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128743  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05867  hypothetical protein  26.71 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000445  pentapeptide repeat family protein  25.98 
 
 		 330 aa  90.1  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3484  hypothetical protein  30.48 
 
 		 330 aa  87.4  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341689 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2738  hypothetical protein  31.58 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  28.3 
 
 		 825 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  28.3 
 
 		 825 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  28.3 
 
 		 825 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  28.3 
 
 		 825 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  28.3 
 
 		 825 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  28.63 
 
 		 862 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  28.63 
 
 		 825 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  27.31 
 
 		 976 aa  73.6  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  25.53 
 
 		 949 aa  72.8  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2827  hypothetical protein  24.64 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  26.84 
 
 		 846 aa  63.2  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  29.38 
 
 		 844 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  26.82 
 
 		 870 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6142  hypothetical protein  35.66 
 
 		 192 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3786  hypothetical protein  25.21 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  28.77 
 
 		 886 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  27.1 
 
 		 881 aa  56.6  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  28.05 
 
 		 866 aa  56.6  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  31.75 
 
 		 872 aa  51.2  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3016  hypothetical protein  47.92 
 
 		 320 aa  46.2  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.935221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>