35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3016 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3016  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  625  1e-178  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3387  hypothetical protein  25.85 
 
 		 338 aa  82.8  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128743  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000445  pentapeptide repeat family protein  28.19 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05867  hypothetical protein  24.32 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2334  hypothetical protein  32.59 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00524729  normal  0.0110062 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4428  hypothetical protein  42.53 
 
 		 445 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2439  hypothetical protein  26.69 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646599  normal  0.310656 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3186  hypothetical protein  30 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3112  hypothetical protein  26.73 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192331  normal  0.139244 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3467  hypothetical protein  26.1 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01180  hypothetical protein  30.67 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.176675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2827  hypothetical protein  23.26 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0538  hypothetical protein  38.82 
 
 		 373 aa  57  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2128  hypothetical protein  30.25 
 
 		 438 aa  56.2  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469876 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4073  hypothetical protein  25.38 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125532 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0171  hypothetical protein  31.01 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6142  hypothetical protein  29.93 
 
 		 192 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  32.48 
 
 		 825 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  32.48 
 
 		 862 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  32.48 
 
 		 825 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  32.48 
 
 		 825 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  32.48 
 
 		 825 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  32.48 
 
 		 825 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2738  hypothetical protein  44.44 
 
 		 383 aa  54.3  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  32.48 
 
 		 825 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7560  hypothetical protein  35.63 
 
 		 348 aa  53.9  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1160  hypothetical protein  43.66 
 
 		 356 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.860855 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0291  hypothetical protein  48.89 
 
 		 337 aa  49.7  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3869  hypothetical protein  28.1 
 
 		 438 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0106797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  41.79 
 
 		 870 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  36.36 
 
 		 976 aa  48.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3786  hypothetical protein  39.76 
 
 		 343 aa  47  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2759  hypothetical protein  47.92 
 
 		 357 aa  46.2  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  42.31 
 
 		 949 aa  46.2  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7055  hypothetical protein  37.5 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0582367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>