34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3484 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3484  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  663    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0538  hypothetical protein  31.02 
 
 		 373 aa  112  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2438  Protein of unknown function DUF2169  28.1 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2334  hypothetical protein  29.01 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00524729  normal  0.0110062 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3112  hypothetical protein  31.03 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192331  normal  0.139244 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3186  hypothetical protein  27.81 
 
 		 335 aa  99.4  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3467  hypothetical protein  30.46 
 
 		 340 aa  99.4  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01180  hypothetical protein  29.57 
 
 		 399 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.176675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0171  hypothetical protein  30.7 
 
 		 370 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1192  hypothetical protein  31 
 
 		 447 aa  95.9  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2439  hypothetical protein  30.34 
 
 		 366 aa  95.1  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646599  normal  0.310656 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0291  hypothetical protein  26.88 
 
 		 337 aa  89  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2759  hypothetical protein  30.48 
 
 		 357 aa  87.4  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3786  hypothetical protein  28.53 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1160  hypothetical protein  34.03 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.860855 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7560  hypothetical protein  28.63 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4073  hypothetical protein  30.58 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125532 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3869  hypothetical protein  27.78 
 
 		 438 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0106797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7055  hypothetical protein  28.85 
 
 		 356 aa  72  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0582367  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2827  hypothetical protein  25.42 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4428  hypothetical protein  26.36 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2128  hypothetical protein  28.4 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469876 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  33.54 
 
 		 976 aa  61.2  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3387  hypothetical protein  24.62 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128743  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2738  hypothetical protein  28.28 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  29.63 
 
 		 825 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  29.17 
 
 		 825 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  29.17 
 
 		 825 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  29.17 
 
 		 825 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  29.17 
 
 		 825 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  29.17 
 
 		 825 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  29.17 
 
 		 862 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  28.46 
 
 		 949 aa  47  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000445  pentapeptide repeat family protein  21.4 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>