28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3869 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3869  hypothetical protein  100 
 
 		 438 aa  907    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0106797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2128  hypothetical protein  61.25 
 
 		 438 aa  555  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469876 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4428  hypothetical protein  29.74 
 
 		 445 aa  173  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1192  hypothetical protein  31.93 
 
 		 447 aa  170  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2438  Protein of unknown function DUF2169  31.14 
 
 		 383 aa  153  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01180  hypothetical protein  28.5 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.176675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0171  hypothetical protein  28.1 
 
 		 370 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2334  hypothetical protein  28.77 
 
 		 370 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00524729  normal  0.0110062 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7560  hypothetical protein  28.5 
 
 		 348 aa  130  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3467  hypothetical protein  29.02 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3112  hypothetical protein  28.68 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192331  normal  0.139244 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2759  hypothetical protein  29.87 
 
 		 357 aa  121  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0538  hypothetical protein  30.28 
 
 		 373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2439  hypothetical protein  29.08 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646599  normal  0.310656 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6142  hypothetical protein  36.3 
 
 		 192 aa  94  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7055  hypothetical protein  25.21 
 
 		 356 aa  89.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0582367  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1160  hypothetical protein  26.54 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.860855 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4073  hypothetical protein  27.11 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125532 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3484  hypothetical protein  27.78 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341689 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0291  hypothetical protein  24.26 
 
 		 337 aa  66.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2738  hypothetical protein  23.57 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3186  hypothetical protein  22.58 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3387  hypothetical protein  24.91 
 
 		 338 aa  57  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128743  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05867  hypothetical protein  36.36 
 
 		 330 aa  54.7  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  34.04 
 
 		 949 aa  51.6  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000445  pentapeptide repeat family protein  28.45 
 
 		 330 aa  50.1  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3016  hypothetical protein  28.1 
 
 		 320 aa  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  34.25 
 
 		 976 aa  43.9  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>