36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2128 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2128  hypothetical protein  100 
 
 
438 aa  906    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.469876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3869  hypothetical protein  61.25 
 
 
438 aa  568  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0106797  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4428  hypothetical protein  26.35 
 
 
445 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1192  hypothetical protein  29.89 
 
 
447 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3112  hypothetical protein  31.69 
 
 
340 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192331  normal  0.139244 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01180  hypothetical protein  27.92 
 
 
399 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.176675  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3467  hypothetical protein  30.73 
 
 
340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0171  hypothetical protein  29.22 
 
 
370 aa  140  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2334  hypothetical protein  30.49 
 
 
370 aa  137  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00524729  normal  0.0110062 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2438  Protein of unknown function DUF2169  29.12 
 
 
383 aa  137  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7560  hypothetical protein  31.28 
 
 
348 aa  132  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2759  hypothetical protein  30 
 
 
357 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2439  hypothetical protein  28.68 
 
 
366 aa  129  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646599  normal  0.310656 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0538  hypothetical protein  28.49 
 
 
373 aa  113  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7055  hypothetical protein  26.33 
 
 
356 aa  97.1  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0582367  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4073  hypothetical protein  29.15 
 
 
373 aa  92  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125532 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6142  hypothetical protein  35.29 
 
 
192 aa  89.7  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1160  hypothetical protein  27.48 
 
 
356 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.860855 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2738  hypothetical protein  26.23 
 
 
383 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3186  hypothetical protein  25.62 
 
 
335 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0291  hypothetical protein  26.01 
 
 
337 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3387  hypothetical protein  27.54 
 
 
338 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128743  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3484  hypothetical protein  28.4 
 
 
330 aa  64.7  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.341689 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  26.61 
 
 
825 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  26.61 
 
 
825 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  26.61 
 
 
825 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  26.61 
 
 
825 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  26.61 
 
 
825 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  26.61 
 
 
825 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  26.61 
 
 
862 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05867  hypothetical protein  29.75 
 
 
330 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3016  hypothetical protein  30.25 
 
 
320 aa  56.2  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  25 
 
 
866 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000445  pentapeptide repeat family protein  29.91 
 
 
330 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 
949 aa  49.3  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  24.19 
 
 
976 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.271954 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>