32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3786 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3786  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  690    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2738  hypothetical protein  31.32 
 
 		 383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3186  hypothetical protein  29.29 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0291  hypothetical protein  26.63 
 
 		 337 aa  93.2  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3484  hypothetical protein  28.53 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341689 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0171  hypothetical protein  29.15 
 
 		 370 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01180  hypothetical protein  28.61 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.176675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1160  hypothetical protein  31.02 
 
 		 356 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.860855 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7055  hypothetical protein  25.68 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0582367  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2438  Protein of unknown function DUF2169  23.53 
 
 		 383 aa  65.9  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2439  hypothetical protein  27.2 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646599  normal  0.310656 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  32.65 
 
 		 825 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  32.65 
 
 		 825 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  32.65 
 
 		 825 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  32.65 
 
 		 825 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  32.65 
 
 		 862 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  32.65 
 
 		 825 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0538  hypothetical protein  23.93 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  32.65 
 
 		 825 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2759  hypothetical protein  25.28 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2334  hypothetical protein  25.68 
 
 		 370 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00524729  normal  0.0110062 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3387  hypothetical protein  25.37 
 
 		 338 aa  51.2  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128743  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4073  hypothetical protein  26.29 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125532 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  27.1 
 
 		 872 aa  51.2  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  28.26 
 
 		 846 aa  50.1  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7560  hypothetical protein  27.05 
 
 		 348 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  28.57 
 
 		 886 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3016  hypothetical protein  39.76 
 
 		 320 aa  47  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000445  pentapeptide repeat family protein  25 
 
 		 330 aa  47  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  25.54 
 
 		 844 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05867  hypothetical protein  23.61 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4428  hypothetical protein  28.05 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>