14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3674 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3674  hypothetical protein  100 
 
 
459 aa  879    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1058  hypothetical protein  68.39 
 
 
929 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0721278  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1394  Molecular chaperone GrpE (heat shock protein)- like protein  32.34 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0877714  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6997  hypothetical protein  32.93 
 
 
256 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1874  hypothetical protein  35.07 
 
 
232 aa  59.3  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.334307  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  27.82 
 
 
1441 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0559  trans-sialidase  46.15 
 
 
331 aa  55.1  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  32.11 
 
 
3471 aa  54.3  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  32.11 
 
 
3472 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  27.01 
 
 
3521 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  34.44 
 
 
607 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3257  hypothetical protein  34.09 
 
 
540 aa  49.3  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8091  hypothetical protein  29.82 
 
 
450 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.623212  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2452  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.63 
 
 
1177 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>