153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5172 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  100 
 
 		 1023 aa  2020    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  42.43 
 
 		 1182 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  38.29 
 
 		 1092 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  36.32 
 
 		 1060 aa  342  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  36.72 
 
 		 1281 aa  339  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  36.14 
 
 		 973 aa  332  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 1119 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 1282 aa  329  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  35.47 
 
 		 1560 aa  328  3e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  37.65 
 
 		 996 aa  325  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  35.64 
 
 		 950 aa  321  3.9999999999999996e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 1077 aa  312  2e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  35.79 
 
 		 974 aa  310  8e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.01 
 
 		 957 aa  310  8e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  34.62 
 
 		 1051 aa  310  1.0000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  35.3 
 
 		 879 aa  304  5.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  37.39 
 
 		 950 aa  302  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  32.49 
 
 		 1148 aa  289  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 1268 aa  286  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 1007 aa  281  4e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 1132 aa  281  6e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  33.79 
 
 		 1004 aa  271  5e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  34.78 
 
 		 905 aa  261  6e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  33.23 
 
 		 1031 aa  260  9e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  33.24 
 
 		 1022 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  32.14 
 
 		 991 aa  251  4e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  33.72 
 
 		 769 aa  249  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 860 aa  248  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  32.97 
 
 		 807 aa  248  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  33.17 
 
 		 801 aa  247  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.75 
 
 		 851 aa  245  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.75 
 
 		 851 aa  245  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.75 
 
 		 851 aa  245  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  34.18 
 
 		 841 aa  244  7e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  33.64 
 
 		 1026 aa  243  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 1435 aa  241  6.999999999999999e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  30.46 
 
 		 669 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  42.58 
 
 		 839 aa  236  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  33.59 
 
 		 817 aa  234  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  31.92 
 
 		 697 aa  234  8.000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  41.12 
 
 		 795 aa  233  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  32.55 
 
 		 797 aa  233  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  45.65 
 
 		 769 aa  232  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  35.44 
 
 		 854 aa  231  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  30.97 
 
 		 683 aa  228  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 		 803 aa  228  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  38.14 
 
 		 818 aa  228  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  38.34 
 
 		 735 aa  227  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  37.4 
 
 		 821 aa  227  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  34.54 
 
 		 763 aa  225  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  30.05 
 
 		 836 aa  225  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  37.8 
 
 		 854 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  43 
 
 		 965 aa  220  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  43.73 
 
 		 1047 aa  220  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  31.96 
 
 		 1152 aa  218  5e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 1034 aa  218  5.9999999999999996e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  38.6 
 
 		 1402 aa  215  2.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  29.49 
 
 		 1000 aa  214  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  30.37 
 
 		 1310 aa  211  5e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  38.52 
 
 		 829 aa  211  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  30.76 
 
 		 637 aa  209  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  39.83 
 
 		 876 aa  209  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  33.06 
 
 		 817 aa  209  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  40.72 
 
 		 843 aa  202  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  42.95 
 
 		 733 aa  193  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  32.46 
 
 		 687 aa  189  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  28.66 
 
 		 832 aa  189  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  33.68 
 
 		 895 aa  181  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  40 
 
 		 863 aa  180  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  28.77 
 
 		 814 aa  172  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  28.15 
 
 		 805 aa  172  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  37.41 
 
 		 670 aa  169  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  29.9 
 
 		 839 aa  162  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  35.09 
 
 		 764 aa  163  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  41.07 
 
 		 832 aa  161  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  34.47 
 
 		 794 aa  157  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  28.57 
 
 		 798 aa  154  8e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  38.26 
 
 		 436 aa  150  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  37.17 
 
 		 799 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  36.11 
 
 		 1076 aa  147  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  41.4 
 
 		 575 aa  147  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  39.04 
 
 		 516 aa  140  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 412 aa  121  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  34.84 
 
 		 769 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  33.55 
 
 		 630 aa  117  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  36.93 
 
 		 484 aa  117  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  35.65 
 
 		 465 aa  115  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  31.25 
 
 		 600 aa  113  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 453 aa  99.8  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  34.2 
 
 		 524 aa  97.8  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  37.7 
 
 		 539 aa  97.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  33.08 
 
 		 485 aa  92  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  31.16 
 
 		 458 aa  81.3  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2795  hypothetical protein  29.41 
 
 		 961 aa  57.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.827572  hitchhiker  0.0000678695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  46.38 
 
 		 765 aa  55.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4693  histidine kinase  25.54 
 
 		 561 aa  52  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4520  ATPase domain-containing protein  25.54 
 
 		 471 aa  51.6  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320419  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 431 aa  51.2  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163384  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0265  sensor histidine kinase  32.73 
 
 		 697 aa  50.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  38.2 
 
 		 465 aa  50.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.854948 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>