275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5183 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  100 
 
 		 863 aa  1693    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  49.14 
 
 		 1000 aa  634  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  39.78 
 
 		 832 aa  429  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  41.37 
 
 		 794 aa  424  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  38.46 
 
 		 814 aa  386  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  33.86 
 
 		 1164 aa  317  8e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  36.28 
 
 		 1148 aa  312  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  32.62 
 
 		 764 aa  290  6e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  32.93 
 
 		 1031 aa  276  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  32.05 
 
 		 1047 aa  265  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  33.38 
 
 		 1022 aa  262  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 1007 aa  239  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  33.53 
 
 		 1281 aa  239  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  32.77 
 
 		 1560 aa  234  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  32.76 
 
 		 839 aa  233  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 1077 aa  232  3e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  32.16 
 
 		 973 aa  232  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 1268 aa  228  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  32.77 
 
 		 798 aa  227  7e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  29.81 
 
 		 1092 aa  226  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 1132 aa  225  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  33.86 
 
 		 950 aa  225  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  32.38 
 
 		 950 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 1119 aa  217  7e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.64 
 
 		 1049 aa  214  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 1182 aa  214  7e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  39.25 
 
 		 1051 aa  213  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  41.87 
 
 		 996 aa  213  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 1282 aa  213  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  31.99 
 
 		 1004 aa  213  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.21 
 
 		 957 aa  209  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  30.69 
 
 		 1060 aa  201  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  29.73 
 
 		 905 aa  195  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  30.26 
 
 		 836 aa  195  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  31.01 
 
 		 807 aa  195  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  40.74 
 
 		 697 aa  193  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  32.16 
 
 		 821 aa  191  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  30.85 
 
 		 895 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  31.38 
 
 		 879 aa  189  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  39.12 
 
 		 974 aa  190  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  35.88 
 
 		 769 aa  189  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  44.62 
 
 		 854 aa  189  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  39.94 
 
 		 801 aa  183  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  36.21 
 
 		 1023 aa  182  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  29.85 
 
 		 669 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  30.03 
 
 		 854 aa  180  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.89 
 
 		 860 aa  179  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  38.63 
 
 		 817 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 		 1435 aa  178  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  29.7 
 
 		 637 aa  177  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  37.2 
 
 		 797 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  28.7 
 
 		 735 aa  176  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  40.15 
 
 		 841 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  38.51 
 
 		 818 aa  174  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  37.85 
 
 		 683 aa  171  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  29.7 
 
 		 1026 aa  170  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  36.69 
 
 		 991 aa  170  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  37.05 
 
 		 1402 aa  169  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 1034 aa  166  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  35.96 
 
 		 839 aa  164  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  34.68 
 
 		 1152 aa  164  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  41.64 
 
 		 843 aa  164  6e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  37.64 
 
 		 876 aa  162  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  40.49 
 
 		 1076 aa  161  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  41.37 
 
 		 1310 aa  157  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  41.6 
 
 		 763 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 		 851 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 		 851 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 		 851 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  36.94 
 
 		 817 aa  154  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  41.06 
 
 		 805 aa  154  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 803 aa  153  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  39.63 
 
 		 965 aa  151  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  29.34 
 
 		 795 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  39.01 
 
 		 733 aa  144  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  38.63 
 
 		 687 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  40.72 
 
 		 670 aa  139  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  36.8 
 
 		 799 aa  137  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  39.7 
 
 		 832 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  40 
 
 		 769 aa  131  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  38.36 
 
 		 575 aa  121  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  35.05 
 
 		 436 aa  107  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  33.66 
 
 		 769 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  31.54 
 
 		 516 aa  100  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  35.32 
 
 		 630 aa  96.3  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 412 aa  92.4  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  36.07 
 
 		 484 aa  92  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  35.51 
 
 		 485 aa  85.1  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  36.07 
 
 		 524 aa  84.7  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  32.68 
 
 		 465 aa  84.3  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 453 aa  79.7  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  32.46 
 
 		 539 aa  79.3  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  33.67 
 
 		 458 aa  68.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0649  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.736737  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0261  osmolarity sensor protein envZ  28.57 
 
 		 437 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0329  osmolarity sensor protein EnvZ  28.62 
 
 		 440 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3487  hypothetical protein  32.47 
 
 		 499 aa  60.1  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0259  sensor histidine kinase  28.95 
 
 		 440 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  25.55 
 
 		 729 aa  56.6  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.42 
 
 		 477 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>