200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1803 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  100 
 
 
973 aa  1914    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.48 
 
 
1049 aa  641    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  40.45 
 
 
950 aa  597  1e-169  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.78 
 
 
957 aa  510  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  37.41 
 
 
974 aa  504  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  36.2 
 
 
1051 aa  499  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.45 
 
 
1119 aa  490  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  46.9 
 
 
950 aa  485  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  43.76 
 
 
1560 aa  468  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  42.9 
 
 
1077 aa  466  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  39.97 
 
 
1092 aa  423  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  39.28 
 
 
1060 aa  393  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  32.7 
 
 
996 aa  390  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 
1282 aa  380  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  36.11 
 
 
879 aa  374  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 
1268 aa  375  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 
1007 aa  350  6e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 
1132 aa  350  9e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  37.67 
 
 
1004 aa  349  1e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
1182 aa  337  5e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  36.52 
 
 
1031 aa  337  7.999999999999999e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  36.19 
 
 
1023 aa  333  7.000000000000001e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  33.29 
 
 
1148 aa  331  4e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  35.61 
 
 
905 aa  329  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  36.74 
 
 
1022 aa  327  7e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  32.46 
 
 
1164 aa  317  5e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  32.8 
 
 
797 aa  302  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  33.8 
 
 
807 aa  298  4e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  35.41 
 
 
669 aa  297  6e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  32.57 
 
 
817 aa  292  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  36.84 
 
 
769 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  34.27 
 
 
683 aa  285  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  32.06 
 
 
821 aa  282  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  34.04 
 
 
991 aa  279  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  31.71 
 
 
836 aa  278  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  36.56 
 
 
1026 aa  278  4e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  34 
 
 
801 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  34.81 
 
 
817 aa  271  4e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  33.02 
 
 
854 aa  266  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.98 
 
 
860 aa  259  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  29.7 
 
 
839 aa  258  4e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  31.8 
 
 
697 aa  258  4e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  32.12 
 
 
965 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  32.06 
 
 
1000 aa  251  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  33.56 
 
 
841 aa  251  6e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  43.17 
 
 
854 aa  249  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  42.48 
 
 
818 aa  249  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  34.31 
 
 
1047 aa  248  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  32.96 
 
 
1402 aa  248  4.9999999999999997e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  31.63 
 
 
795 aa  247  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  29.73 
 
 
832 aa  244  6e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  32.67 
 
 
876 aa  244  7e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  35.67 
 
 
763 aa  244  7.999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  34.33 
 
 
1310 aa  243  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  33.89 
 
 
843 aa  243  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.71 
 
 
1435 aa  240  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  32.83 
 
 
637 aa  237  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.2 
 
 
803 aa  237  8e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 
1034 aa  237  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  30.61 
 
 
735 aa  235  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  41.77 
 
 
1152 aa  234  6e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.82 
 
 
851 aa  234  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.82 
 
 
851 aa  234  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.82 
 
 
851 aa  234  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  40.11 
 
 
829 aa  228  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  32.32 
 
 
863 aa  225  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  30.89 
 
 
794 aa  225  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  31.73 
 
 
769 aa  225  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  32.92 
 
 
839 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  30.11 
 
 
895 aa  212  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  29.78 
 
 
814 aa  209  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  29.99 
 
 
764 aa  208  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  29.88 
 
 
798 aa  206  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  40.11 
 
 
687 aa  204  8e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  42.05 
 
 
733 aa  201  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  34.6 
 
 
1076 aa  198  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  28.97 
 
 
805 aa  196  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  43.52 
 
 
670 aa  182  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  32.49 
 
 
799 aa  176  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  38.99 
 
 
832 aa  175  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  41.01 
 
 
575 aa  171  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  38.39 
 
 
769 aa  152  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  33.94 
 
 
436 aa  146  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  33.46 
 
 
516 aa  140  8.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  30.27 
 
 
600 aa  127  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  34.12 
 
 
484 aa  119  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
412 aa  115  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  28.32 
 
 
465 aa  110  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  30.4 
 
 
630 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  29.63 
 
 
524 aa  103  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 
453 aa  100  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  30.08 
 
 
485 aa  94.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  31 
 
 
539 aa  86.3  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  27.32 
 
 
458 aa  71.2  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  30.66 
 
 
1281 aa  69.7  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.55 
 
 
639 aa  68.2  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.74 
 
 
639 aa  65.5  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.85 
 
 
614 aa  63.9  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.82 
 
 
613 aa  63.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0764  hypothetical protein  39.39 
 
 
765 aa  60.1  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.902908  normal  0.0151558 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>