More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3875 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  100 
 
 
1022 aa  1998    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  81.32 
 
 
1031 aa  1551    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  38.36 
 
 
1164 aa  468  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  41.37 
 
 
1148 aa  467  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  38.74 
 
 
1047 aa  442  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  34.07 
 
 
950 aa  392  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  34.19 
 
 
974 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  32.85 
 
 
1051 aa  361  4e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 
1119 aa  326  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  35.82 
 
 
1281 aa  325  3e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  33.55 
 
 
832 aa  323  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  36.59 
 
 
1092 aa  319  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  35.08 
 
 
794 aa  318  4e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 
1132 aa  316  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  32.14 
 
 
1060 aa  312  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  32.75 
 
 
1000 aa  311  2.9999999999999997e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.44 
 
 
957 aa  308  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
1282 aa  307  6e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 
1007 aa  301  3e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  36.92 
 
 
950 aa  291  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  35.53 
 
 
1560 aa  291  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  32.77 
 
 
814 aa  290  8e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  34.66 
 
 
1004 aa  278  5e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  34.52 
 
 
996 aa  275  4.0000000000000004e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
1182 aa  270  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 
1268 aa  263  8.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  34.49 
 
 
839 aa  263  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  32.85 
 
 
1023 aa  261  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  33.54 
 
 
863 aa  260  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  34.48 
 
 
798 aa  258  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  31.96 
 
 
879 aa  253  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  33.03 
 
 
764 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  33.79 
 
 
841 aa  241  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  31.99 
 
 
817 aa  238  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  42.4 
 
 
1402 aa  236  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  33.42 
 
 
843 aa  234  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  30.38 
 
 
905 aa  233  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  33.68 
 
 
895 aa  230  9e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  32.37 
 
 
836 aa  228  4e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  44.59 
 
 
769 aa  227  8e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  41.98 
 
 
1310 aa  226  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  33.59 
 
 
817 aa  223  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  29.66 
 
 
821 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  43.07 
 
 
829 aa  219  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  32.81 
 
 
807 aa  219  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  32.68 
 
 
854 aa  216  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  32.55 
 
 
797 aa  215  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  29.58 
 
 
854 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  30.62 
 
 
795 aa  214  5.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  32.59 
 
 
965 aa  213  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  31.15 
 
 
697 aa  214  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  35.53 
 
 
801 aa  213  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.26 
 
 
1435 aa  209  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  30.95 
 
 
876 aa  209  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  41.52 
 
 
683 aa  208  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  31.51 
 
 
637 aa  207  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  43.33 
 
 
763 aa  206  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  31.67 
 
 
669 aa  206  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  29.46 
 
 
991 aa  204  8e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 
860 aa  204  9e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  30.51 
 
 
1026 aa  199  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.3 
 
 
803 aa  195  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  29.31 
 
 
839 aa  195  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  39.4 
 
 
818 aa  194  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  29.77 
 
 
1152 aa  191  8e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 
1034 aa  184  7e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.96 
 
 
851 aa  184  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.96 
 
 
851 aa  184  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.96 
 
 
851 aa  184  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  40.43 
 
 
687 aa  181  7e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  29.69 
 
 
735 aa  180  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  39.25 
 
 
769 aa  177  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  46.01 
 
 
670 aa  166  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  42.2 
 
 
575 aa  164  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  36.62 
 
 
805 aa  160  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  37.93 
 
 
1076 aa  155  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  40 
 
 
733 aa  152  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  37.55 
 
 
832 aa  146  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  37.5 
 
 
769 aa  131  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  35.43 
 
 
436 aa  122  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  31.47 
 
 
516 aa  115  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  36.82 
 
 
484 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  30.35 
 
 
524 aa  103  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 
412 aa  97.4  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  31.71 
 
 
630 aa  93.6  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  35.03 
 
 
485 aa  90.1  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  30.58 
 
 
465 aa  85.5  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 
453 aa  83.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  33.15 
 
 
539 aa  77  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  50 
 
 
1049 aa  73.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  28.17 
 
 
458 aa  71.6  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  23.17 
 
 
438 aa  67.4  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  42.22 
 
 
1077 aa  65.1  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  40.24 
 
 
973 aa  65.1  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0764  hypothetical protein  46.05 
 
 
765 aa  64.3  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.902908  normal  0.0151558 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1957  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.56 
 
 
664 aa  63.2  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.257458  normal  0.211978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4317  ATPase domain-containing protein  28.68 
 
 
600 aa  62  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5024  histidine kinase  34.69 
 
 
485 aa  61.6  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168004  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2369  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.57 
 
 
664 aa  59.7  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0315396  normal  0.0961625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7402  histidine kinase  29.04 
 
 
524 aa  57.4  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13845  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>