187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2445 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  100 
 
 		 1076 aa  2110    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  43.31 
 
 		 799 aa  264  8e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  29.01 
 
 		 950 aa  221  6e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  28.57 
 
 		 1560 aa  216  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 1007 aa  213  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  30.98 
 
 		 973 aa  206  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 1119 aa  204  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.28 
 
 		 1132 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 1268 aa  195  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  35.67 
 
 		 1310 aa  192  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  38.23 
 
 		 797 aa  191  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  39.3 
 
 		 1152 aa  191  5.999999999999999e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  28.17 
 
 		 1281 aa  191  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.78 
 
 		 1049 aa  191  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  29.02 
 
 		 817 aa  191  8e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  42.05 
 
 		 769 aa  190  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.07 
 
 		 957 aa  188  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  36.98 
 
 		 821 aa  187  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  36.5 
 
 		 1402 aa  187  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  36.44 
 
 		 991 aa  186  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 1282 aa  185  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 1435 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  33.09 
 
 		 996 aa  182  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  34.49 
 
 		 905 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  39.13 
 
 		 974 aa  182  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  35.29 
 
 		 817 aa  182  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  36.11 
 
 		 807 aa  181  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  38.2 
 
 		 669 aa  181  5.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 860 aa  181  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  41.31 
 
 		 1182 aa  180  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  40.65 
 
 		 801 aa  180  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  28.78 
 
 		 1031 aa  179  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 1077 aa  177  6e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 1034 aa  178  6e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  39.53 
 
 		 950 aa  177  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  33.27 
 
 		 965 aa  175  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  27.58 
 
 		 814 aa  173  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  37.66 
 
 		 683 aa  173  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  36.42 
 
 		 818 aa  173  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  35.03 
 
 		 1004 aa  171  7e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  35.1 
 
 		 832 aa  169  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  26.17 
 
 		 879 aa  169  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  36.6 
 
 		 841 aa  168  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  36.02 
 
 		 805 aa  169  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  41.9 
 
 		 697 aa  168  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  38.71 
 
 		 1000 aa  167  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  39.19 
 
 		 637 aa  167  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  40.16 
 
 		 854 aa  167  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  26.47 
 
 		 1164 aa  167  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  26.15 
 
 		 1148 aa  167  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 803 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  32.01 
 
 		 836 aa  165  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  25.41 
 
 		 1047 aa  164  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  27.07 
 
 		 1060 aa  163  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  36.53 
 
 		 829 aa  162  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  37.7 
 
 		 795 aa  162  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  36.36 
 
 		 763 aa  161  7e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 851 aa  160  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 851 aa  160  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 851 aa  160  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  35.63 
 
 		 854 aa  160  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  40.91 
 
 		 863 aa  160  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  27.29 
 
 		 1092 aa  159  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  37.5 
 
 		 687 aa  158  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  37.74 
 
 		 733 aa  158  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  33.72 
 
 		 876 aa  157  9e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  36.79 
 
 		 1022 aa  157  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  36.61 
 
 		 1026 aa  155  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  35.31 
 
 		 735 aa  154  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  29.2 
 
 		 1023 aa  153  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  34.04 
 
 		 769 aa  152  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  32.03 
 
 		 764 aa  147  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  34.53 
 
 		 794 aa  147  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  34.11 
 
 		 839 aa  147  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  36.03 
 
 		 895 aa  142  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  31.65 
 
 		 798 aa  133  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  30.79 
 
 		 670 aa  132  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  32.66 
 
 		 839 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  33.94 
 
 		 436 aa  115  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  34.48 
 
 		 769 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  34.11 
 
 		 575 aa  108  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  29.17 
 
 		 832 aa  104  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  31.05 
 
 		 516 aa  95.9  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  32.52 
 
 		 485 aa  95.1  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  35.55 
 
 		 600 aa  94.7  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  34.13 
 
 		 630 aa  94  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  34.26 
 
 		 524 aa  88.2  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 412 aa  86.7  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  30.99 
 
 		 484 aa  85.9  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  32.42 
 
 		 465 aa  77.8  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 		 453 aa  77.8  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  31.61 
 
 		 539 aa  72.4  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  29.89 
 
 		 458 aa  72.4  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0903  histidine kinase  27.91 
 
 		 472 aa  63.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.442245  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4317  ATPase domain-containing protein  26.67 
 
 		 600 aa  62.4  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5024  histidine kinase  31.71 
 
 		 485 aa  60.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168004  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4514  ATPase domain-containing protein  32.26 
 
 		 485 aa  60.1  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  22.61 
 
 		 469 aa  57.4  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.35 
 
 		 757 aa  56.6  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.856998  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  25.93 
 
 		 566 aa  57  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>