More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1189 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
851 aa  1680    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
851 aa  1680    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.11 
 
 
860 aa  929    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  53.3 
 
 
876 aa  789    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
851 aa  1680    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  65.3 
 
 
803 aa  749    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  43.69 
 
 
1092 aa  288  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  44.57 
 
 
996 aa  277  8e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  47.51 
 
 
1560 aa  275  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 
1182 aa  273  9e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  44.21 
 
 
950 aa  270  7e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
1119 aa  270  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  34.39 
 
 
974 aa  267  8e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 
1132 aa  265  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  33.38 
 
 
1051 aa  259  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
1077 aa  256  9e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  40.19 
 
 
1023 aa  253  8.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  46.57 
 
 
1281 aa  253  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  44.12 
 
 
973 aa  252  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.56 
 
 
957 aa  250  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.43 
 
 
1268 aa  249  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
1007 aa  245  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  48.23 
 
 
1049 aa  243  9e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.35 
 
 
1282 aa  241  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  46.03 
 
 
950 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  45.31 
 
 
1004 aa  236  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  30.23 
 
 
879 aa  232  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  42.78 
 
 
1164 aa  224  7e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  43.42 
 
 
801 aa  223  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  43.07 
 
 
1148 aa  221  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  41.29 
 
 
817 aa  218  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  40.16 
 
 
1047 aa  217  5.9999999999999996e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  41.75 
 
 
769 aa  215  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 
1435 aa  209  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  32.62 
 
 
797 aa  209  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  40.71 
 
 
817 aa  208  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  40.56 
 
 
1031 aa  206  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  33.43 
 
 
807 aa  206  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 
1034 aa  205  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  41.8 
 
 
1022 aa  203  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  32.91 
 
 
821 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  35.73 
 
 
1402 aa  201  3.9999999999999996e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  31.05 
 
 
1310 aa  200  9e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  40.26 
 
 
841 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  37.5 
 
 
818 aa  198  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  41.2 
 
 
733 aa  198  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  37.97 
 
 
735 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  39.37 
 
 
669 aa  196  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  38.41 
 
 
854 aa  196  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  38.61 
 
 
637 aa  196  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  33.33 
 
 
854 aa  196  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  38.51 
 
 
1152 aa  194  6e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  33.5 
 
 
795 aa  192  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  28.19 
 
 
832 aa  191  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  40.72 
 
 
769 aa  191  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  36.14 
 
 
991 aa  189  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  34.6 
 
 
836 aa  188  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  38.89 
 
 
1026 aa  187  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  43.02 
 
 
895 aa  187  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  36.29 
 
 
794 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  38.6 
 
 
763 aa  185  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  37.09 
 
 
697 aa  181  5.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  34.95 
 
 
764 aa  179  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  36.34 
 
 
829 aa  177  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  28.96 
 
 
843 aa  175  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  37.11 
 
 
683 aa  175  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  36.8 
 
 
798 aa  172  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  36.34 
 
 
687 aa  169  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  34.77 
 
 
799 aa  168  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  35.92 
 
 
839 aa  168  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  37.97 
 
 
1000 aa  168  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  38.17 
 
 
965 aa  167  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  37.69 
 
 
839 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  38.26 
 
 
814 aa  166  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  34.42 
 
 
1076 aa  166  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  37.27 
 
 
863 aa  160  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  43.3 
 
 
832 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  35.09 
 
 
805 aa  150  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  33.11 
 
 
670 aa  134  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  39.27 
 
 
769 aa  134  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  38.46 
 
 
575 aa  130  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  36.76 
 
 
436 aa  124  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  35.59 
 
 
484 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  32.67 
 
 
516 aa  108  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  33.22 
 
 
465 aa  106  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  34.95 
 
 
630 aa  94.7  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  36.49 
 
 
485 aa  93.6  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 
412 aa  93.2  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
453 aa  91.3  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  35.27 
 
 
524 aa  88.2  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  28.14 
 
 
600 aa  87.4  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  31.4 
 
 
458 aa  80.5  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  31.87 
 
 
539 aa  77.8  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
674 aa  68.9  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 
535 aa  64.7  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0433443  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 
535 aa  64.7  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4983  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 
535 aa  63.9  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0185741 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2527  histidine kinase  26.27 
 
 
535 aa  63.9  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0731082 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 
453 aa  63.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1725  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
407 aa  62.4  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>