157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5487 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  100 
 
 		 600 aa  1155    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  74.82 
 
 		 630 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  60.69 
 
 		 412 aa  340  2.9999999999999998e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  62.01 
 
 		 465 aa  325  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.14 
 
 		 453 aa  296  7e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  46.97 
 
 		 516 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  50.57 
 
 		 539 aa  219  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  45.22 
 
 		 436 aa  183  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 1007 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  34.81 
 
 		 836 aa  158  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  37.16 
 
 		 817 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  37.46 
 
 		 769 aa  153  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  37.46 
 
 		 735 aa  153  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  33.93 
 
 		 697 aa  153  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  35.43 
 
 		 669 aa  151  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  34.63 
 
 		 683 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  37.5 
 
 		 905 aa  148  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  34.67 
 
 		 991 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  37.62 
 
 		 854 aa  146  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 1132 aa  146  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  31.23 
 
 		 950 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  33.13 
 
 		 818 aa  145  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  34.78 
 
 		 801 aa  144  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  35.35 
 
 		 797 aa  143  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  36.63 
 
 		 637 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  30.9 
 
 		 854 aa  139  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  40.2 
 
 		 829 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 1282 aa  137  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  30.71 
 
 		 973 aa  137  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  31.04 
 
 		 1560 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  31.55 
 
 		 839 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 1077 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  31.36 
 
 		 807 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  35.74 
 
 		 965 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  32.63 
 
 		 841 aa  132  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  32.18 
 
 		 805 aa  132  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  30.29 
 
 		 1281 aa  131  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 1182 aa  130  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  31.03 
 
 		 763 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.41 
 
 		 1049 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.95 
 
 		 957 aa  128  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  34.69 
 
 		 524 aa  128  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 		 1119 aa  128  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  34.16 
 
 		 821 aa  126  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  31.9 
 
 		 950 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  31.93 
 
 		 1026 aa  123  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  30.27 
 
 		 974 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  34.58 
 
 		 670 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  32.52 
 
 		 1023 aa  121  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  32 
 
 		 795 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 1034 aa  119  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  30.77 
 
 		 1051 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  31.12 
 
 		 843 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  37.04 
 
 		 687 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  35.25 
 
 		 458 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  32.63 
 
 		 1402 aa  114  5e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  34.85 
 
 		 1152 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  30.13 
 
 		 996 aa  111  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  29.62 
 
 		 817 aa  110  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  40 
 
 		 485 aa  109  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  28.9 
 
 		 1092 aa  107  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  33.33 
 
 		 769 aa  107  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 1268 aa  106  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  35.48 
 
 		 575 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 1435 aa  103  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  35.02 
 
 		 1076 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  34.38 
 
 		 1310 aa  102  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  34.41 
 
 		 863 aa  101  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  26.76 
 
 		 1060 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  27.87 
 
 		 1004 aa  99  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  28.85 
 
 		 1148 aa  99.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  29.41 
 
 		 1031 aa  99  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  34.52 
 
 		 769 aa  98.6  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  30.17 
 
 		 1047 aa  97.1  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  28.63 
 
 		 1022 aa  96.3  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  29.2 
 
 		 879 aa  94.4  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  28.52 
 
 		 1164 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  32.75 
 
 		 733 aa  91.3  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  30.06 
 
 		 1000 aa  91.3  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  33.48 
 
 		 814 aa  90.9  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 851 aa  90.5  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 851 aa  90.5  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 851 aa  90.5  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  31.64 
 
 		 764 aa  89.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  32.88 
 
 		 484 aa  87.8  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  29.03 
 
 		 832 aa  87.4  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  33.33 
 
 		 794 aa  84.7  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  35.92 
 
 		 799 aa  85.1  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 860 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  32.52 
 
 		 832 aa  80.1  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  25.08 
 
 		 798 aa  78.6  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  33.15 
 
 		 895 aa  77.4  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  24.29 
 
 		 839 aa  75.1  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  30.13 
 
 		 876 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 803 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5712  histidine kinase  33.93 
 
 		 483 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2092  histidine kinase  30.47 
 
 		 555 aa  55.5  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00961022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  33.02 
 
 		 771 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1283  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 632 aa  51.2  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000223104  hitchhiker  0.0000247295 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 		 467 aa  50.8  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>