253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4889 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  65.3 
 
 
851 aa  748    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  65.3 
 
 
851 aa  748    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  68.18 
 
 
860 aa  1048    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  65.3 
 
 
851 aa  748    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
803 aa  1576    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  50.95 
 
 
876 aa  729    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  46.05 
 
 
1092 aa  283  7.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 
1119 aa  282  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  35.49 
 
 
950 aa  280  8e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  44.22 
 
 
1560 aa  276  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  39.91 
 
 
996 aa  270  5.9999999999999995e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
1182 aa  266  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  35.13 
 
 
1060 aa  262  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  34 
 
 
973 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 
1268 aa  244  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.44 
 
 
957 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  41.52 
 
 
1077 aa  244  5e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  40.58 
 
 
1023 aa  241  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  32.29 
 
 
1281 aa  240  6.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.67 
 
 
1049 aa  238  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  44.34 
 
 
1004 aa  236  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  45.75 
 
 
974 aa  233  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 
1282 aa  233  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  29.54 
 
 
879 aa  232  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
1132 aa  231  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  31.36 
 
 
1051 aa  231  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  45.1 
 
 
950 aa  224  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  40.58 
 
 
1047 aa  217  5.9999999999999996e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  42.38 
 
 
1164 aa  217  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  40.46 
 
 
1031 aa  215  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
1007 aa  214  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  37.93 
 
 
1022 aa  212  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  42.82 
 
 
1148 aa  211  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  35.5 
 
 
801 aa  209  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  38.06 
 
 
905 aa  201  5e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  40.84 
 
 
769 aa  201  6e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 
1034 aa  198  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  34.32 
 
 
832 aa  197  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  30.49 
 
 
1310 aa  196  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  36.11 
 
 
895 aa  191  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  37.03 
 
 
817 aa  191  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  38.69 
 
 
637 aa  190  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  35.24 
 
 
839 aa  189  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  35.28 
 
 
669 aa  189  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 
1435 aa  187  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  38.14 
 
 
841 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  36.17 
 
 
1152 aa  185  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  30.09 
 
 
798 aa  185  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  34.67 
 
 
817 aa  184  6e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  34.05 
 
 
836 aa  181  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  31.78 
 
 
821 aa  181  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  34.64 
 
 
991 aa  181  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  33.07 
 
 
794 aa  181  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  32.75 
 
 
797 aa  179  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  35.2 
 
 
1402 aa  180  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  35.49 
 
 
764 aa  178  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  38.41 
 
 
763 aa  179  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  39.94 
 
 
829 aa  177  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  37.38 
 
 
807 aa  177  6e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  37.79 
 
 
733 aa  176  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  28.55 
 
 
1026 aa  175  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  37.34 
 
 
795 aa  174  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  34.56 
 
 
1076 aa  174  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  36.14 
 
 
818 aa  172  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  33.91 
 
 
697 aa  172  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  34.91 
 
 
735 aa  172  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  33.76 
 
 
683 aa  171  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  40.96 
 
 
843 aa  170  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  35.48 
 
 
769 aa  167  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  31.67 
 
 
854 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  32.64 
 
 
839 aa  165  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  35.78 
 
 
814 aa  165  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  35.34 
 
 
799 aa  160  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  37.69 
 
 
863 aa  160  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  36.25 
 
 
1000 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  44.44 
 
 
832 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  35.9 
 
 
965 aa  154  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  32.46 
 
 
805 aa  147  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  33.14 
 
 
670 aa  140  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  32.87 
 
 
687 aa  139  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  39.42 
 
 
575 aa  132  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  36.47 
 
 
769 aa  121  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  34.53 
 
 
436 aa  103  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  34.45 
 
 
484 aa  100  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  32.23 
 
 
516 aa  99.4  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  32.37 
 
 
465 aa  95.1  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
453 aa  89.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
412 aa  88.6  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  30.63 
 
 
630 aa  87  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  33.33 
 
 
485 aa  78.2  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  29.65 
 
 
539 aa  77.8  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  28.44 
 
 
600 aa  72.8  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  28.92 
 
 
524 aa  72.4  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  30.95 
 
 
458 aa  72.4  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0764  hypothetical protein  35.51 
 
 
765 aa  66.6  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.902908  normal  0.0151558 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 
453 aa  62.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5322  histidine kinase sensor  26.17 
 
 
529 aa  60.1  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1670  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
494 aa  60.1  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422523 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  25 
 
 
438 aa  59.3  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  23.03 
 
 
469 aa  58.9  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>