101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1437 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 
485 aa  931    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  49.64 
 
 
524 aa  227  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  34.72 
 
 
436 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  36.97 
 
 
516 aa  144  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  35.89 
 
 
1560 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 
1007 aa  128  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  34.15 
 
 
458 aa  127  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
412 aa  126  7e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  36.93 
 
 
854 aa  124  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  36.36 
 
 
805 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  37.31 
 
 
697 aa  123  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  34.51 
 
 
836 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  32.35 
 
 
807 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  37.17 
 
 
991 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 
1132 aa  116  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  38.57 
 
 
465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 
1282 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  33.33 
 
 
1281 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  29.55 
 
 
795 aa  114  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  33.33 
 
 
817 aa  113  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  36.98 
 
 
669 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 
453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  33.85 
 
 
829 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  38.89 
 
 
801 aa  110  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  31.08 
 
 
769 aa  110  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  37.5 
 
 
841 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  29.86 
 
 
905 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  34.38 
 
 
965 aa  107  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  32.43 
 
 
818 aa  106  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  35 
 
 
821 aa  106  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  36.6 
 
 
670 aa  106  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  30.97 
 
 
763 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
1182 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  34.87 
 
 
797 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  34.38 
 
 
854 aa  105  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  33.99 
 
 
630 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  36.49 
 
 
735 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  40 
 
 
600 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  33.19 
 
 
687 aa  99.8  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  31.01 
 
 
996 aa  99.4  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  31.72 
 
 
1076 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  34.23 
 
 
1000 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  34.2 
 
 
817 aa  98.2  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  30.15 
 
 
973 aa  98.2  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  36.68 
 
 
637 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  33.33 
 
 
1026 aa  97.8  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  32.91 
 
 
974 aa  97.8  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  30.99 
 
 
1092 aa  97.4  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.93 
 
 
1049 aa  97.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
1268 aa  96.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  35.5 
 
 
1310 aa  95.9  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  36.57 
 
 
764 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  31.69 
 
 
950 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  36.7 
 
 
1004 aa  95.9  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  33.33 
 
 
799 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  30.48 
 
 
879 aa  95.5  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 
860 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  35.9 
 
 
1164 aa  94.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  37.5 
 
 
843 aa  94.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  34.4 
 
 
1031 aa  94.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  36.9 
 
 
794 aa  94.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 
1077 aa  94.4  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 
851 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 
851 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 
851 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  35.03 
 
 
1022 aa  94  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  36.18 
 
 
683 aa  94  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  33.08 
 
 
1023 aa  93.6  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  30.58 
 
 
769 aa  93.6  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  34.56 
 
 
1148 aa  92.8  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  36.16 
 
 
1402 aa  92  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
1435 aa  92  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.96 
 
 
957 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
1034 aa  90.5  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  38.1 
 
 
575 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  30.83 
 
 
832 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 
1119 aa  88.6  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  29.34 
 
 
1051 aa  88.2  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  32.67 
 
 
484 aa  87.8  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  36.98 
 
 
769 aa  87.4  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  35.51 
 
 
863 aa  87  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  37.21 
 
 
1152 aa  87  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  27.6 
 
 
839 aa  86.3  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  33.67 
 
 
1047 aa  86.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  34.17 
 
 
539 aa  86.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  29.61 
 
 
832 aa  85.9  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  34.87 
 
 
1060 aa  83.2  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  30.46 
 
 
876 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  35.23 
 
 
814 aa  80.1  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  31.92 
 
 
950 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  31.78 
 
 
839 aa  75.1  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  33.33 
 
 
895 aa  73.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  32.31 
 
 
798 aa  73.2  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
803 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  34.8 
 
 
733 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1586  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 
436 aa  53.5  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.631328  normal  0.769342 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4714  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
528 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4448  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 
589 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 
865 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2107  two-component VirA-like sensor kinase  32.59 
 
 
820 aa  43.9  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>