23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0764 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0820  hypothetical protein  81.26 
 
 		 744 aa  1022    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.931123  normal  0.0681477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0764  hypothetical protein  100 
 
 		 765 aa  1464    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.902908  normal  0.0151558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0739  hypothetical protein  50.43 
 
 		 499 aa  101  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  45.88 
 
 		 950 aa  65.1  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  46.05 
 
 		 1022 aa  63.9  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  42.68 
 
 		 1281 aa  62  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 		 1282 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  39.39 
 
 		 973 aa  59.7  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  44.74 
 
 		 1031 aa  59.7  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.42 
 
 		 1119 aa  58.9  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 803 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  65.85 
 
 		 1049 aa  56.6  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  28.48 
 
 		 2449 aa  54.7  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  60.98 
 
 		 1560 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  65 
 
 		 957 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 1077 aa  52  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  33.98 
 
 		 1051 aa  51.6  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  56.1 
 
 		 974 aa  50.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7122  transposase IS111A/IS1328/IS1533  31.5 
 
 		 410 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  48.98 
 
 		 996 aa  49.7  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  37.84 
 
 		 1164 aa  49.3  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  45.45 
 
 		 1047 aa  48.5  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  36.99 
 
 		 1148 aa  47  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>