149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7862 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  100 
 
 		 1560 aa  3086    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  43.1 
 
 		 950 aa  476  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  43.79 
 
 		 973 aa  476  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.65 
 
 		 1049 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.76 
 
 		 957 aa  445  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  40.93 
 
 		 1281 aa  439  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  40.51 
 
 		 1051 aa  435  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 		 1119 aa  432  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 		 1282 aa  429  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 		 1077 aa  423  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  40.22 
 
 		 974 aa  420  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  39.25 
 
 		 1092 aa  412  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  41.01 
 
 		 950 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  36.89 
 
 		 996 aa  369  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  36.39 
 
 		 1004 aa  367  1e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 		 1132 aa  367  1e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  37.65 
 
 		 1060 aa  365  5.0000000000000005e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 1007 aa  359  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  36.29 
 
 		 879 aa  358  2.9999999999999997e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 1268 aa  345  5e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 1182 aa  340  9.999999999999999e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  35.47 
 
 		 1023 aa  337  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  36.76 
 
 		 1164 aa  329  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  37.83 
 
 		 1031 aa  315  2.9999999999999996e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  35.39 
 
 		 1148 aa  315  3.9999999999999997e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  34.89 
 
 		 905 aa  315  4.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  33.54 
 
 		 807 aa  298  6e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  36.09 
 
 		 769 aa  290  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  31.42 
 
 		 991 aa  290  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  33.58 
 
 		 1026 aa  289  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  45.32 
 
 		 1022 aa  286  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  33.61 
 
 		 818 aa  285  5.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.02 
 
 		 860 aa  285  7.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  32.42 
 
 		 821 aa  281  8e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  32.38 
 
 		 817 aa  281  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  32.74 
 
 		 697 aa  279  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  33.1 
 
 		 854 aa  279  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  34.15 
 
 		 669 aa  278  6e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  40.94 
 
 		 836 aa  277  9e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  32.42 
 
 		 1047 aa  276  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  32.28 
 
 		 854 aa  276  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  48.06 
 
 		 841 aa  273  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  32.67 
 
 		 683 aa  273  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  46.33 
 
 		 797 aa  270  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  35.55 
 
 		 801 aa  265  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  34 
 
 		 735 aa  263  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 		 803 aa  259  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  31.93 
 
 		 839 aa  258  5e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.66 
 
 		 851 aa  257  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.66 
 
 		 851 aa  257  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.66 
 
 		 851 aa  257  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  32.4 
 
 		 795 aa  254  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  49.83 
 
 		 763 aa  253  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  31.07 
 
 		 817 aa  251  8e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  30.8 
 
 		 1310 aa  251  8e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  43.1 
 
 		 637 aa  250  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  30.78 
 
 		 1402 aa  248  6e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 1034 aa  248  8e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  44.07 
 
 		 876 aa  247  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  47.08 
 
 		 965 aa  246  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  31.52 
 
 		 843 aa  246  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  44.32 
 
 		 829 aa  245  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  34.02 
 
 		 769 aa  240  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  42.55 
 
 		 1152 aa  237  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  33.33 
 
 		 863 aa  234  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  32.01 
 
 		 1000 aa  230  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  29.78 
 
 		 805 aa  230  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  30.19 
 
 		 895 aa  224  8e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  28.83 
 
 		 832 aa  224  8e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  36.57 
 
 		 794 aa  220  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  32.02 
 
 		 839 aa  220  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  46.08 
 
 		 733 aa  218  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  43.49 
 
 		 687 aa  209  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  32.58 
 
 		 798 aa  207  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  40.06 
 
 		 799 aa  206  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  27.79 
 
 		 1076 aa  205  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  30.55 
 
 		 814 aa  200  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  50 
 
 		 670 aa  201  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  38.89 
 
 		 764 aa  198  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 		 1435 aa  198  8.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  41.74 
 
 		 832 aa  189  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  44.24 
 
 		 575 aa  176  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  43.89 
 
 		 769 aa  171  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  42.61 
 
 		 436 aa  171  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  33.96 
 
 		 516 aa  157  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 412 aa  138  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  39.44 
 
 		 484 aa  134  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  34.27 
 
 		 524 aa  129  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  33.86 
 
 		 630 aa  127  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  35.89 
 
 		 485 aa  126  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  31.04 
 
 		 600 aa  125  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  32.41 
 
 		 465 aa  124  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 453 aa  109  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  36.46 
 
 		 539 aa  107  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  33.33 
 
 		 458 aa  100  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  23.36 
 
 		 438 aa  66.6  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4018  osmolarity sensor protein  25.23 
 
 		 438 aa  58.2  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.35 
 
 		 613 aa  58.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.35 
 
 		 614 aa  57.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0739  hypothetical protein  43.21 
 
 		 499 aa  57  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>