294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1821 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 		 1049 aa  2076    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  42.06 
 
 		 973 aa  649    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  44.15 
 
 		 974 aa  677    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  51.01 
 
 		 950 aa  805    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  41.6 
 
 		 1051 aa  630  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  52.24 
 
 		 957 aa  612  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  55.18 
 
 		 950 aa  601  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.31 
 
 		 1119 aa  504  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  43.12 
 
 		 1560 aa  473  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  44.75 
 
 		 1281 aa  470  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  41.99 
 
 		 1077 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  42.75 
 
 		 1092 aa  459  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 		 1282 aa  425  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  39.85 
 
 		 1004 aa  397  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.88 
 
 		 1268 aa  399  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  38.1 
 
 		 1060 aa  389  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  38.75 
 
 		 996 aa  385  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 1007 aa  383  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  39.33 
 
 		 879 aa  378  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 		 1132 aa  369  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 1182 aa  348  3e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  37.06 
 
 		 1031 aa  347  8.999999999999999e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  34.6 
 
 		 1164 aa  322  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  33.09 
 
 		 1148 aa  320  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  33.33 
 
 		 905 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  34.2 
 
 		 807 aa  285  4.0000000000000003e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  34.13 
 
 		 797 aa  283  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  32.61 
 
 		 1026 aa  281  6e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  34.32 
 
 		 769 aa  278  4e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  33.04 
 
 		 817 aa  276  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  33.57 
 
 		 821 aa  276  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  33.18 
 
 		 683 aa  271  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  43.92 
 
 		 836 aa  262  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  32.87 
 
 		 817 aa  263  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  32.93 
 
 		 697 aa  263  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  32.66 
 
 		 841 aa  260  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  31.59 
 
 		 669 aa  258  4e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  31.7 
 
 		 1000 aa  257  9e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  40.82 
 
 		 854 aa  255  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.01 
 
 		 860 aa  254  8.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  31.67 
 
 		 1152 aa  251  6e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  29.35 
 
 		 832 aa  251  6e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  32.13 
 
 		 854 aa  248  6e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  45.66 
 
 		 876 aa  245  3e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  43.21 
 
 		 818 aa  243  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  30.5 
 
 		 991 aa  243  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  31.28 
 
 		 839 aa  243  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  29.71 
 
 		 1402 aa  242  2.9999999999999997e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.57 
 
 		 1435 aa  241  4e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  45.16 
 
 		 801 aa  241  5e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  44.03 
 
 		 763 aa  240  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.31 
 
 		 851 aa  238  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.31 
 
 		 851 aa  238  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.31 
 
 		 851 aa  238  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  32.73 
 
 		 965 aa  236  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  33.03 
 
 		 795 aa  235  4.0000000000000004e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  32.08 
 
 		 843 aa  234  6e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  31.7 
 
 		 895 aa  234  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.88 
 
 		 1034 aa  233  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.12 
 
 		 803 aa  233  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  30.56 
 
 		 637 aa  229  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  30.62 
 
 		 1310 aa  228  4e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  33.83 
 
 		 794 aa  228  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  41.34 
 
 		 829 aa  226  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  30.48 
 
 		 735 aa  225  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  30.85 
 
 		 863 aa  219  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  41.33 
 
 		 769 aa  219  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  42.95 
 
 		 687 aa  207  9e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  42 
 
 		 733 aa  204  9e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  30.33 
 
 		 839 aa  201  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  28.92 
 
 		 814 aa  197  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  36.65 
 
 		 799 aa  195  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  36.05 
 
 		 764 aa  191  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  28.28 
 
 		 805 aa  183  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  41.83 
 
 		 670 aa  180  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  38.12 
 
 		 832 aa  171  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  40.17 
 
 		 575 aa  169  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  28.37 
 
 		 798 aa  168  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  36.64 
 
 		 436 aa  153  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  39.64 
 
 		 769 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  33.46 
 
 		 516 aa  135  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  30.16 
 
 		 600 aa  127  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  27.83 
 
 		 465 aa  124  8e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 412 aa  124  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  31.58 
 
 		 630 aa  123  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  36.11 
 
 		 484 aa  119  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  31.84 
 
 		 524 aa  116  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 453 aa  105  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  29.03 
 
 		 485 aa  96.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  34.97 
 
 		 539 aa  93.6  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  30.12 
 
 		 458 aa  87.8  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1713  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.23 
 
 		 666 aa  79  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000425798  normal  0.0665929 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1114  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.75 
 
 		 700 aa  79  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.655641 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2282  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.63 
 
 		 664 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.330304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  50 
 
 		 1022 aa  75.5  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.62 
 
 		 668 aa  75.1  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2242  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.41 
 
 		 664 aa  74.7  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1813  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.77 
 
 		 664 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.280908  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2325  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.93 
 
 		 664 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  hitchhiker  0.00420774 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.13 
 
 		 649 aa  68.6  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>