More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0816 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  100 
 
 		 1164 aa  2301    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  79.9 
 
 		 1148 aa  1694    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  43.28 
 
 		 1031 aa  478  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  40.86 
 
 		 1022 aa  459  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  42.58 
 
 		 1047 aa  444  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  37.24 
 
 		 1092 aa  362  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  31.35 
 
 		 1051 aa  352  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  30.76 
 
 		 1077 aa  345  2.9999999999999997e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  36.76 
 
 		 950 aa  345  4e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  33.92 
 
 		 832 aa  338  3.9999999999999995e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  37.02 
 
 		 1560 aa  330  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  36.01 
 
 		 1000 aa  330  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  33.54 
 
 		 974 aa  327  9e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 1007 aa  326  2e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  32.14 
 
 		 973 aa  324  6e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.78 
 
 		 1049 aa  319  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 1182 aa  318  3e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 1119 aa  315  2.9999999999999996e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  36.41 
 
 		 863 aa  315  3.9999999999999997e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  37.43 
 
 		 996 aa  314  5.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.72 
 
 		 1282 aa  313  1e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  37.43 
 
 		 950 aa  309  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  34.74 
 
 		 794 aa  307  9.000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 1132 aa  306  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  36.24 
 
 		 1060 aa  301  6e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  34.25 
 
 		 839 aa  301  6e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.21 
 
 		 957 aa  301  7e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  35.18 
 
 		 879 aa  298  3e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 1268 aa  294  8e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  34.72 
 
 		 798 aa  287  8e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  34.48 
 
 		 1004 aa  278  3e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  32.52 
 
 		 814 aa  274  7e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  32.58 
 
 		 764 aa  271  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  31.95 
 
 		 905 aa  249  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  32.22 
 
 		 817 aa  244  9e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  36.36 
 
 		 797 aa  243  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  32.06 
 
 		 1026 aa  239  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  31.47 
 
 		 1402 aa  238  4e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 1435 aa  238  4e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  33.27 
 
 		 683 aa  238  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  34.12 
 
 		 807 aa  238  5.0000000000000005e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 		 860 aa  235  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  28.76 
 
 		 836 aa  231  5e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  30.82 
 
 		 1152 aa  231  5e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  30.76 
 
 		 991 aa  228  5.0000000000000005e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  32.56 
 
 		 841 aa  228  5.0000000000000005e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  31.16 
 
 		 697 aa  228  6e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  30.06 
 
 		 669 aa  226  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  33.12 
 
 		 843 aa  223  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  42.04 
 
 		 769 aa  223  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  32.35 
 
 		 818 aa  221  7.999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  31.49 
 
 		 854 aa  220  8.999999999999998e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  30.66 
 
 		 895 aa  219  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  39.62 
 
 		 637 aa  218  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  31.2 
 
 		 795 aa  217  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.57 
 
 		 851 aa  214  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.57 
 
 		 851 aa  214  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.57 
 
 		 851 aa  214  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.22 
 
 		 803 aa  214  7e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 1034 aa  214  7e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  32.77 
 
 		 801 aa  213  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  28.61 
 
 		 839 aa  212  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  41.54 
 
 		 1310 aa  210  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  33.15 
 
 		 735 aa  209  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  29.05 
 
 		 821 aa  209  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  42.36 
 
 		 763 aa  206  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  43.05 
 
 		 854 aa  205  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  41.47 
 
 		 829 aa  205  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  34.81 
 
 		 769 aa  205  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  40.31 
 
 		 876 aa  203  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  30.11 
 
 		 817 aa  194  7e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  28.56 
 
 		 965 aa  190  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  39.71 
 
 		 805 aa  188  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  39.35 
 
 		 687 aa  181  5.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  44.71 
 
 		 670 aa  175  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  45.45 
 
 		 575 aa  172  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  35.11 
 
 		 799 aa  167  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  43.72 
 
 		 832 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  38.46 
 
 		 733 aa  164  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  38.46 
 
 		 769 aa  129  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  33.59 
 
 		 436 aa  122  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  36.99 
 
 		 484 aa  113  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  32.92 
 
 		 516 aa  104  8e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 412 aa  92.4  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  35.9 
 
 		 485 aa  92  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  29.32 
 
 		 465 aa  89.4  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  26.4 
 
 		 600 aa  85.5  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  29.84 
 
 		 524 aa  83.2  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 453 aa  82.8  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  31.94 
 
 		 539 aa  76.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.27 
 
 		 668 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  28.79 
 
 		 458 aa  69.7  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  35.65 
 
 		 465 aa  67.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.854948 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  30.34 
 
 		 1281 aa  65.1  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  31.69 
 
 		 477 aa  65.1  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 		 453 aa  65.1  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6750  histidine kinase  38.53 
 
 		 394 aa  62.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479634  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4068  histidine kinase  30.37 
 
 		 594 aa  62.4  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379101  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4318  ATPase domain-containing protein  36.11 
 
 		 593 aa  62.4  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819924  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0336  histidine kinase  30.74 
 
 		 410 aa  62  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>