More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5272 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  100 
 
 		 1047 aa  2096    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  38.1 
 
 		 1031 aa  503  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  42.07 
 
 		 1164 aa  433  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  39.93 
 
 		 1148 aa  430  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  42.53 
 
 		 1022 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  36.46 
 
 		 764 aa  365  2e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  38.05 
 
 		 974 aa  314  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  34.66 
 
 		 1092 aa  305  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  34.52 
 
 		 1051 aa  297  6e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  29.05 
 
 		 832 aa  297  6e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  31.07 
 
 		 950 aa  287  5.999999999999999e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  31.55 
 
 		 814 aa  275  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 1132 aa  273  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  29.84 
 
 		 1000 aa  273  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  31.04 
 
 		 794 aa  271  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  30.94 
 
 		 1281 aa  269  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  32.95 
 
 		 1560 aa  270  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 1007 aa  269  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 1268 aa  266  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.59 
 
 		 1119 aa  266  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  48.52 
 
 		 1077 aa  264  6.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  34.47 
 
 		 1004 aa  262  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  41.84 
 
 		 863 aa  258  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  35.46 
 
 		 973 aa  256  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  44.04 
 
 		 1060 aa  255  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.91 
 
 		 1282 aa  251  4e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  34.07 
 
 		 950 aa  246  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 		 1182 aa  245  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  32.07 
 
 		 879 aa  237  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  40.4 
 
 		 1402 aa  233  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  39.07 
 
 		 876 aa  233  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  36.38 
 
 		 807 aa  229  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.65 
 
 		 860 aa  226  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  31.51 
 
 		 895 aa  224  9e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  34 
 
 		 1023 aa  224  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 		 1435 aa  222  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  39.14 
 
 		 817 aa  222  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  40.75 
 
 		 797 aa  219  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  29.6 
 
 		 839 aa  217  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  30.12 
 
 		 841 aa  215  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  41.32 
 
 		 669 aa  213  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  40.69 
 
 		 769 aa  212  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  30.4 
 
 		 817 aa  211  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  32.97 
 
 		 836 aa  210  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  34.85 
 
 		 1152 aa  207  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 		 851 aa  206  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 		 851 aa  206  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 		 851 aa  206  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 		 803 aa  205  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  35.03 
 
 		 854 aa  204  7e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  29.36 
 
 		 637 aa  204  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  30.77 
 
 		 839 aa  202  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  31.1 
 
 		 843 aa  201  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  40.67 
 
 		 829 aa  198  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 1034 aa  197  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  29.05 
 
 		 798 aa  196  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  39.38 
 
 		 697 aa  196  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  43.95 
 
 		 854 aa  193  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  33.93 
 
 		 821 aa  193  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  36.75 
 
 		 683 aa  192  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  39.03 
 
 		 801 aa  191  7e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  39.38 
 
 		 687 aa  190  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  37.54 
 
 		 1026 aa  189  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  37.58 
 
 		 795 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  39.72 
 
 		 818 aa  186  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  38.5 
 
 		 763 aa  182  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  37.08 
 
 		 799 aa  179  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  34.84 
 
 		 735 aa  177  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  29.71 
 
 		 965 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  37.11 
 
 		 769 aa  172  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  38.17 
 
 		 733 aa  166  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  40.27 
 
 		 670 aa  153  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  41.18 
 
 		 832 aa  153  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  41.82 
 
 		 575 aa  151  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  35.74 
 
 		 1076 aa  151  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  32.39 
 
 		 805 aa  148  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  35.92 
 
 		 769 aa  125  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  30.21 
 
 		 436 aa  125  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  33.86 
 
 		 516 aa  120  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  35.94 
 
 		 484 aa  106  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  30.2 
 
 		 630 aa  95.9  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 412 aa  90.5  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  30.17 
 
 		 600 aa  88.6  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 453 aa  87.8  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  30.25 
 
 		 465 aa  87  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  29.22 
 
 		 524 aa  86.3  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  33.67 
 
 		 485 aa  84  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  32.8 
 
 		 458 aa  77  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  29.53 
 
 		 539 aa  68.6  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  26.92 
 
 		 477 aa  67  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2114  ATP-binding region ATPase domain protein  30.69 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.673781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  31.71 
 
 		 465 aa  62  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.854948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.67 
 
 		 957 aa  62  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0053  two component sensor histidine kinase  27.91 
 
 		 867 aa  61.2  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 455 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 		 960 aa  59.7  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.53 
 
 		 1049 aa  60.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.44 
 
 		 406 aa  59.7  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3215  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 477 aa  59.3  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  41.18 
 
 		 996 aa  58.9  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>