176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3175 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1435 aa  2781    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  37.84 
 
 		 1402 aa  474  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  39.29 
 
 		 1310 aa  473  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  46.41 
 
 		 1152 aa  456  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.49 
 
 		 1034 aa  353  1e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  31.65 
 
 		 1281 aa  272  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 1268 aa  256  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  34.37 
 
 		 973 aa  253  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  39.55 
 
 		 1560 aa  253  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  35.02 
 
 		 1023 aa  252  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  39.32 
 
 		 950 aa  246  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  42.58 
 
 		 1051 aa  244  7.999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 1282 aa  244  9e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  36.79 
 
 		 1092 aa  244  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.2 
 
 		 1049 aa  243  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 1119 aa  241  5.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 1132 aa  241  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  32.77 
 
 		 1004 aa  238  8e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 1007 aa  237  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  33.23 
 
 		 1164 aa  237  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  32.43 
 
 		 1148 aa  234  8.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  32.39 
 
 		 996 aa  233  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  42.45 
 
 		 974 aa  232  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  44.19 
 
 		 1077 aa  231  8e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  46.59 
 
 		 950 aa  228  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.54 
 
 		 957 aa  226  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  42.68 
 
 		 1031 aa  226  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.54 
 
 		 860 aa  224  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  41.01 
 
 		 905 aa  222  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  41.46 
 
 		 1022 aa  221  6e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  41.03 
 
 		 1047 aa  220  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 		 1182 aa  220  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  36.06 
 
 		 817 aa  220  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  32.02 
 
 		 879 aa  217  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  42.16 
 
 		 1060 aa  216  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  32.13 
 
 		 876 aa  214  7e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  39.27 
 
 		 821 aa  210  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  33.49 
 
 		 801 aa  210  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  41.97 
 
 		 769 aa  205  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  31.52 
 
 		 807 aa  202  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  40.76 
 
 		 841 aa  198  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  41.36 
 
 		 669 aa  198  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  30.1 
 
 		 839 aa  196  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  29.66 
 
 		 637 aa  195  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  32.14 
 
 		 735 aa  194  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  31.04 
 
 		 817 aa  193  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  33.93 
 
 		 843 aa  192  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  39.31 
 
 		 854 aa  191  5.999999999999999e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  38.56 
 
 		 991 aa  191  7e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  39.62 
 
 		 854 aa  189  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  34.77 
 
 		 965 aa  189  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  42.41 
 
 		 763 aa  188  7e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  37.6 
 
 		 836 aa  188  7e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  39.01 
 
 		 797 aa  185  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  36.36 
 
 		 1076 aa  184  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  38.49 
 
 		 683 aa  183  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  43.05 
 
 		 733 aa  183  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  35.31 
 
 		 1000 aa  181  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  28.44 
 
 		 795 aa  181  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  39.45 
 
 		 829 aa  180  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  39.38 
 
 		 818 aa  180  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 		 803 aa  180  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  38.39 
 
 		 697 aa  180  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  39.76 
 
 		 895 aa  176  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  29.73 
 
 		 805 aa  173  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  36.61 
 
 		 1026 aa  172  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  33.86 
 
 		 832 aa  169  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  39.82 
 
 		 863 aa  169  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  40.81 
 
 		 687 aa  169  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  39.51 
 
 		 814 aa  169  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  34.83 
 
 		 794 aa  167  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  33.82 
 
 		 798 aa  164  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  39.81 
 
 		 670 aa  152  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  35.33 
 
 		 839 aa  147  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  33.03 
 
 		 764 aa  144  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  38.94 
 
 		 575 aa  132  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  34.7 
 
 		 832 aa  130  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  35.75 
 
 		 769 aa  120  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  35.45 
 
 		 436 aa  120  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  33.99 
 
 		 516 aa  112  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  35.02 
 
 		 484 aa  105  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  37.81 
 
 		 630 aa  101  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  31.62 
 
 		 600 aa  100  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 412 aa  97.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 453 aa  96.3  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  34.81 
 
 		 465 aa  93.6  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  38.58 
 
 		 485 aa  90.1  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  34.57 
 
 		 539 aa  84.7  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  33.09 
 
 		 524 aa  83.2  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  29.48 
 
 		 458 aa  69.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5024  histidine kinase  35.86 
 
 		 485 aa  68.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168004  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4514  ATPase domain-containing protein  35.14 
 
 		 485 aa  67  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  24.39 
 
 		 468 aa  62.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 445 aa  60.1  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 		 464 aa  60.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0367152  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0234  ATP-binding region ATPase domain protein  22.29 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1126  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3386  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 		 439 aa  57  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.99 
 
 		 470 aa  56.6  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.3 
 
 		 459 aa  54.3  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>