222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0940 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.65 
 
 		 1119 aa  984    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1077 aa  2159    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  43.11 
 
 		 973 aa  472  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.95 
 
 		 1049 aa  464  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  34.79 
 
 		 1051 aa  451  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  40.88 
 
 		 950 aa  435  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.97 
 
 		 957 aa  426  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  38.87 
 
 		 1560 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  41.6 
 
 		 950 aa  402  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  39.82 
 
 		 974 aa  402  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  39.12 
 
 		 1281 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  38.37 
 
 		 1092 aa  398  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 		 1282 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  31.54 
 
 		 1148 aa  364  4e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  37.27 
 
 		 1060 aa  355  2.9999999999999997e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 1182 aa  342  2.9999999999999998e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  35.87 
 
 		 879 aa  338  1.9999999999999998e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  35.93 
 
 		 1004 aa  335  3e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  37.42 
 
 		 996 aa  335  4e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  33.74 
 
 		 1031 aa  329  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  32.03 
 
 		 1023 aa  320  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 1268 aa  317  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 1132 aa  315  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 1007 aa  313  1e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  31.76 
 
 		 836 aa  277  8e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  34.54 
 
 		 807 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  32.44 
 
 		 1047 aa  271  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  33.05 
 
 		 905 aa  268  5e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  32.81 
 
 		 683 aa  265  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  30.64 
 
 		 832 aa  263  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  45.4 
 
 		 797 aa  261  6e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  32.09 
 
 		 841 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  29.96 
 
 		 821 aa  256  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  31.59 
 
 		 1026 aa  256  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  33.99 
 
 		 817 aa  254  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  29.88 
 
 		 965 aa  254  6e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  32.09 
 
 		 876 aa  254  8.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  31.49 
 
 		 854 aa  249  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 860 aa  248  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 851 aa  247  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 851 aa  247  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 851 aa  247  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  32.87 
 
 		 818 aa  245  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  31.34 
 
 		 697 aa  243  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  44.84 
 
 		 769 aa  242  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  31.15 
 
 		 669 aa  242  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  45.19 
 
 		 801 aa  242  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  41.87 
 
 		 763 aa  239  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 		 803 aa  238  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  45.79 
 
 		 854 aa  238  6e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  32.52 
 
 		 794 aa  237  8e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  29.45 
 
 		 839 aa  236  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  31.07 
 
 		 863 aa  235  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.01 
 
 		 1435 aa  233  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  32.46 
 
 		 817 aa  231  5e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  31.97 
 
 		 735 aa  226  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  29.61 
 
 		 1402 aa  226  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  29.82 
 
 		 814 aa  225  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  29.9 
 
 		 795 aa  223  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  29.44 
 
 		 839 aa  221  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  38.89 
 
 		 991 aa  219  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  41.93 
 
 		 829 aa  219  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  40.8 
 
 		 637 aa  217  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  31.99 
 
 		 798 aa  216  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  37.24 
 
 		 895 aa  215  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  39.88 
 
 		 1310 aa  215  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  39.35 
 
 		 1152 aa  206  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  42.47 
 
 		 769 aa  206  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  38.53 
 
 		 764 aa  201  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  38.68 
 
 		 687 aa  199  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  50.23 
 
 		 670 aa  198  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  38.87 
 
 		 733 aa  187  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  34.71 
 
 		 805 aa  185  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  36.83 
 
 		 799 aa  184  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  42.66 
 
 		 832 aa  183  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  38.28 
 
 		 1076 aa  173  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  39.63 
 
 		 575 aa  156  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  42.34 
 
 		 769 aa  150  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  31.25 
 
 		 436 aa  150  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  34.74 
 
 		 516 aa  142  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  40.09 
 
 		 484 aa  125  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  27.64 
 
 		 465 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  29.54 
 
 		 600 aa  122  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 412 aa  120  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  35.76 
 
 		 539 aa  109  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  31.13 
 
 		 524 aa  108  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 453 aa  101  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  29.89 
 
 		 485 aa  93.6  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  30.32 
 
 		 458 aa  80.5  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  43.18 
 
 		 1022 aa  65.5  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5024  histidine kinase  34.44 
 
 		 485 aa  61.2  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168004  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  28.49 
 
 		 1164 aa  60.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.55 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32760  signal transduction histidine kinase  25.19 
 
 		 449 aa  58.5  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4514  ATPase domain-containing protein  33.77 
 
 		 485 aa  57.4  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.09 
 
 		 613 aa  55.1  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1446  histidine kinase  26.21 
 
 		 461 aa  53.5  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4653  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 446 aa  53.5  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.724731 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.73 
 
 		 639 aa  53.5  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  25.73 
 
 		 472 aa  53.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>