More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3193 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  52.1 
 
 		 769 aa  688    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  49.07 
 
 		 801 aa  666    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  100 
 
 		 817 aa  1605    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  46.76 
 
 		 821 aa  623  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  44.15 
 
 		 669 aa  483  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  41.71 
 
 		 905 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  38.77 
 
 		 807 aa  451  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  38.56 
 
 		 843 aa  442  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  40.53 
 
 		 683 aa  442  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  40.6 
 
 		 841 aa  437  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  40.59 
 
 		 697 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  40.19 
 
 		 735 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  39.78 
 
 		 637 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  36.64 
 
 		 797 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  35.46 
 
 		 854 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 		 1132 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 1007 aa  387  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  33.33 
 
 		 836 aa  361  4e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  36.75 
 
 		 818 aa  337  5e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  32.48 
 
 		 854 aa  336  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  32.28 
 
 		 839 aa  326  1e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  34.67 
 
 		 795 aa  325  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  34.98 
 
 		 991 aa  323  6e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  38.22 
 
 		 763 aa  310  8e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  31.78 
 
 		 805 aa  307  5.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  33.12 
 
 		 950 aa  303  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  34.37 
 
 		 829 aa  296  9e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  34.22 
 
 		 973 aa  293  8e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  35.11 
 
 		 687 aa  283  7.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  32.01 
 
 		 1560 aa  282  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  33.58 
 
 		 965 aa  281  4e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  31.95 
 
 		 1026 aa  276  9e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  33.23 
 
 		 1281 aa  275  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 1119 aa  274  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.85 
 
 		 1049 aa  269  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  34.24 
 
 		 769 aa  267  5.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  31.12 
 
 		 1051 aa  262  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.78 
 
 		 1282 aa  259  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  31.11 
 
 		 1148 aa  257  7e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 1268 aa  256  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.05 
 
 		 957 aa  255  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  30.97 
 
 		 1031 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 1077 aa  252  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  33.97 
 
 		 950 aa  252  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  45.14 
 
 		 996 aa  251  4e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  33.39 
 
 		 817 aa  251  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  43.4 
 
 		 1092 aa  250  8e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  30.63 
 
 		 974 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  30.38 
 
 		 1164 aa  249  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  29.82 
 
 		 1004 aa  246  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  32.93 
 
 		 879 aa  243  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  32.15 
 
 		 1023 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  43.58 
 
 		 1152 aa  234  5e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  31.41 
 
 		 1022 aa  231  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 1182 aa  231  4e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  31.41 
 
 		 1402 aa  228  4e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  41.56 
 
 		 1060 aa  226  9e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  36.91 
 
 		 1310 aa  226  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 1435 aa  218  5e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.39 
 
 		 1034 aa  217  8e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  39.78 
 
 		 1047 aa  216  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 		 860 aa  210  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  28.77 
 
 		 832 aa  206  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.64 
 
 		 851 aa  206  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.64 
 
 		 851 aa  206  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.64 
 
 		 851 aa  206  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  44.3 
 
 		 733 aa  204  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  37.07 
 
 		 670 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  32.12 
 
 		 895 aa  196  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  32.77 
 
 		 863 aa  188  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 803 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  38.58 
 
 		 814 aa  183  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  37.27 
 
 		 1076 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  38.32 
 
 		 794 aa  181  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  32.53 
 
 		 799 aa  178  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  31.11 
 
 		 798 aa  178  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  36.97 
 
 		 1000 aa  177  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  36.69 
 
 		 516 aa  175  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  30.87 
 
 		 764 aa  169  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  33.87 
 
 		 839 aa  167  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  41.55 
 
 		 769 aa  157  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  36.11 
 
 		 436 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  42.86 
 
 		 575 aa  154  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  37.16 
 
 		 600 aa  145  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  35.56 
 
 		 465 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 		 453 aa  143  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  33.33 
 
 		 484 aa  140  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  36.24 
 
 		 832 aa  135  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 412 aa  134  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  35.19 
 
 		 630 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  33.74 
 
 		 524 aa  113  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  30.27 
 
 		 485 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  31.48 
 
 		 458 aa  105  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  34.09 
 
 		 539 aa  101  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 465 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0290384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 465 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00272877  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 465 aa  72  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000014063  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2398  histidine kinase  30.16 
 
 		 465 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00201135  normal  0.0208658 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3963  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 		 861 aa  66.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4290  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 861 aa  65.1  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731111  normal  0.889005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>