More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2200 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  100 
 
 		 769 aa  1509    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  45.31 
 
 		 795 aa  496  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  35.75 
 
 		 769 aa  335  2e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  35.08 
 
 		 991 aa  322  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  31.34 
 
 		 839 aa  320  5e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  35.06 
 
 		 841 aa  320  5e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  32.69 
 
 		 821 aa  318  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  37.33 
 
 		 697 aa  318  4e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  36.03 
 
 		 843 aa  314  3.9999999999999997e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  33.58 
 
 		 807 aa  312  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  33.96 
 
 		 669 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  33.42 
 
 		 735 aa  304  5.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  36.17 
 
 		 818 aa  303  9e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  33.8 
 
 		 801 aa  302  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  33.53 
 
 		 836 aa  301  3e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  35.19 
 
 		 637 aa  296  7e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  33.38 
 
 		 854 aa  296  9e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  33.91 
 
 		 683 aa  296  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  32.7 
 
 		 905 aa  295  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  34.31 
 
 		 829 aa  295  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  32.51 
 
 		 763 aa  290  7e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  32.18 
 
 		 817 aa  288  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 1132 aa  287  5e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  32.98 
 
 		 854 aa  279  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.94 
 
 		 1007 aa  263  8e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  34.57 
 
 		 1560 aa  260  7e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  34.18 
 
 		 965 aa  249  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  35.49 
 
 		 687 aa  248  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  45.96 
 
 		 1023 aa  246  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  31.73 
 
 		 973 aa  242  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  31.96 
 
 		 950 aa  241  5e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 1119 aa  240  6.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 1282 aa  240  8e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.65 
 
 		 957 aa  238  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  31.6 
 
 		 805 aa  234  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  34.81 
 
 		 1026 aa  234  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  34.86 
 
 		 974 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.76 
 
 		 1268 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  39.14 
 
 		 1051 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  41.79 
 
 		 1281 aa  224  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.5 
 
 		 1049 aa  224  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  42.68 
 
 		 1182 aa  224  7e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  30.72 
 
 		 1092 aa  221  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  38.29 
 
 		 1004 aa  220  7.999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  35.45 
 
 		 1164 aa  220  8.999999999999998e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 		 1077 aa  219  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  32.2 
 
 		 950 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  43.77 
 
 		 1060 aa  219  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  31.56 
 
 		 996 aa  213  7.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  30.59 
 
 		 879 aa  206  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  32.98 
 
 		 1148 aa  204  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  38.58 
 
 		 1152 aa  203  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  40.73 
 
 		 1031 aa  197  7e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 		 851 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 		 851 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 		 851 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  37.04 
 
 		 1022 aa  196  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  27.9 
 
 		 817 aa  195  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 		 860 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  35.98 
 
 		 1310 aa  188  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  42.64 
 
 		 670 aa  188  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  36.39 
 
 		 1402 aa  187  6e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  37.03 
 
 		 1047 aa  184  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 		 1034 aa  177  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  41.05 
 
 		 733 aa  174  6.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 803 aa  168  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  37.04 
 
 		 876 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  36.19 
 
 		 799 aa  166  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  38.75 
 
 		 1076 aa  160  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  30.22 
 
 		 794 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  33.17 
 
 		 832 aa  154  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  35.69 
 
 		 895 aa  153  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  28.5 
 
 		 764 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  41.58 
 
 		 769 aa  144  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  33.08 
 
 		 1000 aa  142  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  42.98 
 
 		 484 aa  140  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  40.16 
 
 		 863 aa  138  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  28.95 
 
 		 839 aa  138  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  29.73 
 
 		 798 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  26.04 
 
 		 814 aa  126  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  36.57 
 
 		 832 aa  123  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  33.76 
 
 		 516 aa  122  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  38.39 
 
 		 436 aa  122  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  36.67 
 
 		 575 aa  105  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 412 aa  97.4  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  34.88 
 
 		 600 aa  96.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  34.87 
 
 		 524 aa  96.3  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  31.21 
 
 		 630 aa  89.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  34.25 
 
 		 465 aa  89  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  31.16 
 
 		 458 aa  89  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  36.98 
 
 		 485 aa  88.6  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 453 aa  83.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  32.46 
 
 		 539 aa  77.4  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 515 aa  63.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 524 aa  61.2  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6750  histidine kinase  37.4 
 
 		 394 aa  60.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479634  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 		 768 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479069  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0737  histidine kinase  34.9 
 
 		 455 aa  59.7  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00375027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1375  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 		 768 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.397027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6454  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 		 768 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>