263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2806 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  100 
 
 		 797 aa  1589    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  44.26 
 
 		 807 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  42.18 
 
 		 669 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  41.06 
 
 		 683 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  41.21 
 
 		 637 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  40.35 
 
 		 735 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  37.95 
 
 		 821 aa  414  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  38.46 
 
 		 697 aa  415  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  36.63 
 
 		 817 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  37.26 
 
 		 801 aa  392  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  34.47 
 
 		 854 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  38.4 
 
 		 841 aa  352  2e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  35.99 
 
 		 769 aa  350  6e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 		 1132 aa  343  5e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  53.77 
 
 		 1007 aa  323  6e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  32.2 
 
 		 836 aa  319  2e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  30.92 
 
 		 839 aa  315  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  31.94 
 
 		 854 aa  303  8.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  32.48 
 
 		 818 aa  303  8.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  32.95 
 
 		 805 aa  298  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  33.29 
 
 		 973 aa  294  4e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  34.31 
 
 		 763 aa  291  4e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  33.64 
 
 		 795 aa  290  6e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  32.7 
 
 		 965 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  34.22 
 
 		 829 aa  282  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  37.13 
 
 		 991 aa  280  9e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  32.45 
 
 		 1281 aa  280  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  34.05 
 
 		 950 aa  278  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 		 1282 aa  277  6e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.85 
 
 		 1049 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  36.33 
 
 		 1560 aa  271  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 1119 aa  270  5.9999999999999995e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  36.88 
 
 		 687 aa  261  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  41.61 
 
 		 1051 aa  257  7e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  47.18 
 
 		 1077 aa  256  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  47.75 
 
 		 957 aa  255  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  33.13 
 
 		 950 aa  255  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  42.26 
 
 		 1026 aa  255  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  40.24 
 
 		 974 aa  250  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  30.09 
 
 		 817 aa  248  4.9999999999999997e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  38 
 
 		 1092 aa  243  9e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  42.24 
 
 		 996 aa  241  4e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  30.17 
 
 		 1164 aa  239  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  43.79 
 
 		 1004 aa  238  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  30.65 
 
 		 1060 aa  238  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 1268 aa  235  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  31.63 
 
 		 769 aa  233  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  32.36 
 
 		 1023 aa  231  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  28.66 
 
 		 1148 aa  231  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  28.43 
 
 		 879 aa  231  5e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 1182 aa  217  5.9999999999999996e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  31.69 
 
 		 1031 aa  217  7e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  31.18 
 
 		 1022 aa  217  8e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  41.18 
 
 		 1047 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  29.57 
 
 		 1000 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  28.4 
 
 		 832 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  39.82 
 
 		 670 aa  201  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 851 aa  197  9e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 851 aa  197  9e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 851 aa  197  9e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 1034 aa  196  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 		 860 aa  195  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  37.36 
 
 		 1402 aa  192  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  39.37 
 
 		 799 aa  191  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  30.18 
 
 		 1152 aa  189  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  36.5 
 
 		 1310 aa  189  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  29.6 
 
 		 764 aa  188  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  38.15 
 
 		 1076 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  30.65 
 
 		 794 aa  185  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  32.86 
 
 		 895 aa  181  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 1435 aa  179  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  40 
 
 		 733 aa  177  7e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  37.99 
 
 		 863 aa  174  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  35.21 
 
 		 814 aa  174  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  39.55 
 
 		 876 aa  172  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  39.12 
 
 		 516 aa  169  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 803 aa  169  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  42.34 
 
 		 769 aa  168  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  37.64 
 
 		 436 aa  157  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  28.02 
 
 		 839 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  38.07 
 
 		 832 aa  146  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  35.66 
 
 		 575 aa  138  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  39.72 
 
 		 484 aa  137  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  32.14 
 
 		 798 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  35.35 
 
 		 600 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  31.17 
 
 		 465 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 412 aa  129  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 453 aa  123  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  35.59 
 
 		 630 aa  121  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  37.1 
 
 		 539 aa  104  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  35.78 
 
 		 485 aa  103  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  31.25 
 
 		 524 aa  97.1  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  31.91 
 
 		 458 aa  87.4  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3731  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5024  histidine kinase  36.19 
 
 		 485 aa  56.6  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168004  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 466 aa  55.1  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00327402  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0649  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 387 aa  54.7  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.736737  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 464 aa  53.9  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0367152  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4094  histidine kinase  30.97 
 
 		 612 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  30.1 
 
 		 469 aa  53.5  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>