291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0310 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1034 aa  1998    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.47 
 
 
1435 aa  370  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  38.54 
 
 
1402 aa  367  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  54.37 
 
 
1152 aa  359  9.999999999999999e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  37.73 
 
 
1310 aa  340  9e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 
1007 aa  264  4.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
1119 aa  254  8.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  31.55 
 
 
1560 aa  253  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.28 
 
 
1268 aa  248  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  30.33 
 
 
950 aa  247  8e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.62 
 
 
1132 aa  241  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  36.43 
 
 
973 aa  238  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  32.67 
 
 
669 aa  238  4e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  31.87 
 
 
1281 aa  237  8e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  31.1 
 
 
879 aa  236  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  29.97 
 
 
1092 aa  234  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 
1282 aa  233  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  30.57 
 
 
801 aa  231  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  32 
 
 
1182 aa  231  6e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.28 
 
 
1049 aa  228  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  30.72 
 
 
807 aa  226  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  32.09 
 
 
991 aa  226  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  42.22 
 
 
1004 aa  224  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  30.43 
 
 
821 aa  224  9e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  30.11 
 
 
1164 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  31.27 
 
 
841 aa  219  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  31.62 
 
 
817 aa  219  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  32.67 
 
 
950 aa  218  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  31.48 
 
 
1023 aa  218  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  38.63 
 
 
817 aa  217  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  32.41 
 
 
735 aa  217  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  31.8 
 
 
905 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.87 
 
 
957 aa  213  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  30.56 
 
 
683 aa  212  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  32.22 
 
 
829 aa  213  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  37.05 
 
 
1051 aa  210  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  31.29 
 
 
769 aa  206  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  36.36 
 
 
996 aa  206  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  31.59 
 
 
843 aa  205  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  30.15 
 
 
839 aa  204  7e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  30.03 
 
 
763 aa  204  8e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  40.49 
 
 
974 aa  201  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  29.32 
 
 
805 aa  201  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  29.32 
 
 
1031 aa  198  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  35.93 
 
 
836 aa  197  6e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  29.94 
 
 
795 aa  197  7e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  31.44 
 
 
797 aa  197  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  39.52 
 
 
876 aa  195  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  36.05 
 
 
1047 aa  191  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  31.58 
 
 
818 aa  191  7e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
851 aa  191  9e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
851 aa  191  9e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
851 aa  191  9e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  45.04 
 
 
733 aa  189  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 
803 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  27.68 
 
 
854 aa  185  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  38.63 
 
 
1022 aa  185  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  36.42 
 
 
697 aa  184  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  28.51 
 
 
854 aa  182  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  38.35 
 
 
965 aa  180  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  31.68 
 
 
1000 aa  179  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  27.74 
 
 
814 aa  176  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  29.88 
 
 
637 aa  174  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  35.29 
 
 
1076 aa  174  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  36.8 
 
 
769 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  30.87 
 
 
863 aa  166  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  38.89 
 
 
895 aa  166  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  35.54 
 
 
687 aa  164  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  30.38 
 
 
1026 aa  156  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  34.8 
 
 
794 aa  156  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  34.82 
 
 
799 aa  153  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  33.15 
 
 
670 aa  152  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  33.08 
 
 
839 aa  153  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  34.28 
 
 
798 aa  150  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  33.24 
 
 
764 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  25.11 
 
 
832 aa  142  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  35.61 
 
 
575 aa  124  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  37.02 
 
 
516 aa  122  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  33.49 
 
 
769 aa  121  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  34.16 
 
 
484 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  39.57 
 
 
539 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  33.8 
 
 
436 aa  112  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  35.71 
 
 
465 aa  111  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 
412 aa  111  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  34.86 
 
 
600 aa  108  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  37.02 
 
 
630 aa  106  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
453 aa  105  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  32.41 
 
 
524 aa  92.4  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  35.06 
 
 
458 aa  92.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  35.23 
 
 
485 aa  86.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1700  Signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 
429 aa  68.6  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0217075  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0470  histidine kinase  32.81 
 
 
425 aa  60.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.53157 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2417  hypothetical protein  34.01 
 
 
379 aa  57.4  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  33.94 
 
 
465 aa  57.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.854948 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2292  hypothetical protein  34.01 
 
 
379 aa  57.4  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.47 
 
 
920 aa  56.2  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0770  histidine kinase  35.04 
 
 
397 aa  55.5  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31890  signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
394 aa  54.7  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.22 
 
 
466 aa  54.7  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2698  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.18 
 
 
595 aa  54.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.155122 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>