244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3054 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  100 
 
 		 829 aa  1618    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  49.92 
 
 		 763 aa  544  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  36.65 
 
 		 836 aa  419  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  37.97 
 
 		 854 aa  419  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  36.34 
 
 		 839 aa  405  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  41.98 
 
 		 965 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  39.94 
 
 		 818 aa  378  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  39.04 
 
 		 991 aa  369  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  36.2 
 
 		 769 aa  361  3e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  41.09 
 
 		 687 aa  345  2e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  36.86 
 
 		 807 aa  343  8e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  38.64 
 
 		 905 aa  341  2.9999999999999998e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  32.82 
 
 		 821 aa  327  5e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  34.49 
 
 		 801 aa  327  5e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.64 
 
 		 1132 aa  325  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  35.22 
 
 		 669 aa  319  1e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  34.03 
 
 		 735 aa  317  7e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  34.4 
 
 		 817 aa  315  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  35.41 
 
 		 797 aa  314  4.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  37.13 
 
 		 841 aa  311  2.9999999999999997e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  35.45 
 
 		 683 aa  309  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  33.3 
 
 		 854 aa  307  5.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  32.76 
 
 		 805 aa  306  8.000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  34.96 
 
 		 843 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.81 
 
 		 1007 aa  298  4e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  35.25 
 
 		 769 aa  292  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  44.5 
 
 		 697 aa  290  6e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  43.29 
 
 		 637 aa  275  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  33.79 
 
 		 795 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  44.32 
 
 		 1560 aa  266  8.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  41.87 
 
 		 1004 aa  256  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.19 
 
 		 1282 aa  252  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  36.71 
 
 		 973 aa  250  8e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 1182 aa  248  3e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  44.11 
 
 		 1281 aa  247  6.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  31.24 
 
 		 950 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  44.72 
 
 		 1026 aa  246  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 		 1268 aa  243  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.78 
 
 		 957 aa  240  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  48.43 
 
 		 1092 aa  239  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  43.49 
 
 		 1077 aa  231  4e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  43 
 
 		 1060 aa  231  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  43.07 
 
 		 1022 aa  231  6e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.11 
 
 		 1049 aa  230  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  41.97 
 
 		 1051 aa  230  7e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  42.77 
 
 		 1031 aa  229  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  31.35 
 
 		 1023 aa  229  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  41.51 
 
 		 974 aa  228  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.06 
 
 		 1119 aa  227  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  38.4 
 
 		 996 aa  223  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 		 1034 aa  222  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  31.19 
 
 		 950 aa  220  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  41.54 
 
 		 670 aa  219  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  42.27 
 
 		 1164 aa  213  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  41.99 
 
 		 1148 aa  213  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  41.37 
 
 		 1047 aa  206  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  37.86 
 
 		 1402 aa  206  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  38.84 
 
 		 1152 aa  206  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  38.12 
 
 		 1310 aa  203  9e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  40 
 
 		 516 aa  201  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.78 
 
 		 860 aa  200  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  43.48 
 
 		 879 aa  200  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 		 1435 aa  193  9e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  37.74 
 
 		 817 aa  192  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39 
 
 		 851 aa  188  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39 
 
 		 851 aa  188  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39 
 
 		 851 aa  188  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  37.03 
 
 		 895 aa  187  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.87 
 
 		 803 aa  182  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  41.1 
 
 		 876 aa  176  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  36.53 
 
 		 1076 aa  173  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  45.81 
 
 		 769 aa  173  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  36.83 
 
 		 1000 aa  168  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  40.7 
 
 		 733 aa  165  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  31.47 
 
 		 832 aa  164  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  28.21 
 
 		 814 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  36.94 
 
 		 436 aa  156  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  38.01 
 
 		 832 aa  155  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  36.1 
 
 		 798 aa  154  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  37.6 
 
 		 839 aa  151  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 		 412 aa  150  9e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  37.98 
 
 		 799 aa  149  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  33.14 
 
 		 794 aa  147  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  41.4 
 
 		 630 aa  143  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  39.91 
 
 		 484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  33.33 
 
 		 764 aa  139  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  41.99 
 
 		 465 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 		 453 aa  135  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  35.92 
 
 		 600 aa  131  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  31.69 
 
 		 524 aa  130  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  38.99 
 
 		 575 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  33.51 
 
 		 458 aa  112  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  33.85 
 
 		 485 aa  108  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  36.82 
 
 		 539 aa  107  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0367152  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4094  histidine kinase  31.53 
 
 		 612 aa  57.4  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5024  histidine kinase  32.47 
 
 		 485 aa  55.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168004  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.89 
 
 		 457 aa  53.5  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1580  sensor histidine kinase  32.29 
 
 		 462 aa  53.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5712  histidine kinase  34.55 
 
 		 483 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>