271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3669 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  100 
 
 		 854 aa  1674    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  39.13 
 
 		 807 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  37.38 
 
 		 905 aa  444  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  35.84 
 
 		 817 aa  425  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  41.59 
 
 		 669 aa  421  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  39.33 
 
 		 769 aa  413  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  37.49 
 
 		 801 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  36.83 
 
 		 683 aa  409  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  38.51 
 
 		 637 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  37.96 
 
 		 697 aa  393  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  36.62 
 
 		 821 aa  395  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  38.31 
 
 		 841 aa  383  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  38.93 
 
 		 735 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 		 1007 aa  372  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  33.85 
 
 		 797 aa  369  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 		 1132 aa  364  4e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  32.57 
 
 		 836 aa  360  5e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  35.15 
 
 		 843 aa  352  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  31.39 
 
 		 839 aa  343  7e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  31.85 
 
 		 854 aa  329  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  34.61 
 
 		 991 aa  328  3e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  36.11 
 
 		 818 aa  315  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  37.48 
 
 		 763 aa  308  3e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  34.02 
 
 		 965 aa  299  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  32.25 
 
 		 795 aa  293  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  36.38 
 
 		 829 aa  292  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  33.14 
 
 		 950 aa  290  7e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 1282 aa  286  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  33.94 
 
 		 1560 aa  276  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  32.27 
 
 		 769 aa  273  9e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 1119 aa  273  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  32.74 
 
 		 973 aa  271  5e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  32.36 
 
 		 1281 aa  270  7e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  33.75 
 
 		 1026 aa  266  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  33.48 
 
 		 687 aa  258  4e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.45 
 
 		 957 aa  251  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 1077 aa  249  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  30.73 
 
 		 805 aa  249  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.35 
 
 		 1049 aa  247  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  33.48 
 
 		 950 aa  246  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 1268 aa  245  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  30.56 
 
 		 1092 aa  240  9e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  29.64 
 
 		 817 aa  235  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  28.23 
 
 		 879 aa  233  9e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  37.58 
 
 		 974 aa  231  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  30.82 
 
 		 1023 aa  230  8e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  30.54 
 
 		 1060 aa  229  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  29.86 
 
 		 1004 aa  222  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  38.32 
 
 		 1051 aa  218  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  28.66 
 
 		 996 aa  216  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  29.25 
 
 		 1031 aa  213  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  51.63 
 
 		 670 aa  211  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  30.23 
 
 		 1148 aa  211  6e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  29.53 
 
 		 1022 aa  207  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  45.53 
 
 		 1164 aa  204  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 1182 aa  203  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  38.15 
 
 		 1152 aa  202  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 		 860 aa  201  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  30.35 
 
 		 1310 aa  200  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  28.66 
 
 		 1402 aa  197  8.000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  28.39 
 
 		 832 aa  195  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 1435 aa  194  7e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  43.95 
 
 		 1047 aa  193  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  45.49 
 
 		 516 aa  192  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 		 851 aa  192  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 		 851 aa  192  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 		 851 aa  192  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  28.84 
 
 		 1000 aa  191  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 1034 aa  187  8e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  30.03 
 
 		 863 aa  185  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  42.4 
 
 		 895 aa  181  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  44.06 
 
 		 876 aa  181  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  28.66 
 
 		 814 aa  179  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  45.78 
 
 		 575 aa  173  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  44.2 
 
 		 436 aa  173  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  42.47 
 
 		 733 aa  171  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  28.24 
 
 		 839 aa  167  8e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 803 aa  167  9e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  40.16 
 
 		 1076 aa  166  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  39.44 
 
 		 799 aa  163  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  42.79 
 
 		 769 aa  163  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  26.17 
 
 		 794 aa  158  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  38.53 
 
 		 832 aa  157  8e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  27.12 
 
 		 764 aa  152  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  36.23 
 
 		 798 aa  147  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 412 aa  145  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  44.5 
 
 		 484 aa  142  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  39.67 
 
 		 600 aa  134  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  39 
 
 		 465 aa  132  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  40.48 
 
 		 630 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 453 aa  125  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  38.46 
 
 		 524 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  39.69 
 
 		 485 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  34.59 
 
 		 458 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  36.07 
 
 		 539 aa  104  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 515 aa  59.3  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1586  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.631328  normal  0.769342 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3793  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 		 664 aa  57.4  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.191798 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4514  ATPase domain-containing protein  37.14 
 
 		 485 aa  57  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5712  histidine kinase  33.33 
 
 		 483 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>