198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_24610 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1182 aa  2355    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  42.43 
 
 		 1023 aa  462  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  33.44 
 
 		 950 aa  381  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  38.23 
 
 		 1092 aa  379  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 		 1119 aa  374  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  37.79 
 
 		 1060 aa  366  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  38.56 
 
 		 996 aa  351  5e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  31.2 
 
 		 1051 aa  350  8e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.2 
 
 		 1049 aa  348  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  36.95 
 
 		 973 aa  342  2e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  36.84 
 
 		 879 aa  342  2e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  36.35 
 
 		 1560 aa  337  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  36.36 
 
 		 1281 aa  336  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 1282 aa  323  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  36.38 
 
 		 1164 aa  317  9e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.9 
 
 		 957 aa  316  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  38.62 
 
 		 950 aa  314  7.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 		 1132 aa  306  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  33.05 
 
 		 974 aa  294  6e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 860 aa  282  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 		 1268 aa  283  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  34.6 
 
 		 1004 aa  281  7e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  33.18 
 
 		 1031 aa  275  5.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  34.56 
 
 		 1022 aa  274  6e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  33.49 
 
 		 905 aa  264  8e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 803 aa  260  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 851 aa  259  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 851 aa  259  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 851 aa  259  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  30.28 
 
 		 1402 aa  250  1e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  32.59 
 
 		 769 aa  250  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  32.05 
 
 		 821 aa  247  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  40 
 
 		 1047 aa  244  5e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  32.22 
 
 		 807 aa  242  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  31.73 
 
 		 669 aa  241  8e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  33.6 
 
 		 801 aa  240  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  32.32 
 
 		 683 aa  240  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  33.13 
 
 		 841 aa  238  4e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  42.47 
 
 		 876 aa  237  8e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  39.95 
 
 		 854 aa  237  8e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  32.22 
 
 		 697 aa  236  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  31.69 
 
 		 991 aa  236  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  32.99 
 
 		 817 aa  235  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  40 
 
 		 1152 aa  235  5e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  33.61 
 
 		 829 aa  234  9e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  32.05 
 
 		 839 aa  234  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  32.36 
 
 		 1026 aa  234  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  30.91 
 
 		 836 aa  233  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  31.9 
 
 		 1310 aa  232  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  34.26 
 
 		 818 aa  231  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  32.08 
 
 		 797 aa  225  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  32.77 
 
 		 763 aa  224  8e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  31.67 
 
 		 843 aa  223  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.7 
 
 		 1034 aa  221  5e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  31.46 
 
 		 735 aa  220  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 		 1435 aa  219  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  41.33 
 
 		 769 aa  219  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  28.65 
 
 		 832 aa  219  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  31.76 
 
 		 637 aa  219  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  31.14 
 
 		 863 aa  218  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  30.56 
 
 		 795 aa  218  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  38.35 
 
 		 895 aa  217  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  31.36 
 
 		 839 aa  214  5.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  29.82 
 
 		 1000 aa  212  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  29.65 
 
 		 798 aa  201  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  31.63 
 
 		 805 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  30.59 
 
 		 817 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  36.34 
 
 		 965 aa  198  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  34.76 
 
 		 854 aa  196  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  32.69 
 
 		 794 aa  196  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  42.47 
 
 		 733 aa  196  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  36.13 
 
 		 764 aa  182  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  38.49 
 
 		 1076 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  28.08 
 
 		 814 aa  179  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  44.64 
 
 		 670 aa  177  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  36.81 
 
 		 687 aa  172  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  41.47 
 
 		 832 aa  167  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  35.17 
 
 		 799 aa  166  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  38.78 
 
 		 575 aa  146  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  38.84 
 
 		 769 aa  132  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  30.43 
 
 		 516 aa  129  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  32.94 
 
 		 484 aa  129  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  32.67 
 
 		 436 aa  123  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  33.61 
 
 		 600 aa  120  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  34.24 
 
 		 630 aa  117  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 412 aa  114  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  31.42 
 
 		 465 aa  108  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  33.6 
 
 		 524 aa  109  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  38.14 
 
 		 485 aa  102  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  33.33 
 
 		 539 aa  101  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 453 aa  100  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  32.07 
 
 		 458 aa  92  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  30.77 
 
 		 465 aa  58.2  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.854948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  28.44 
 
 		 412 aa  56.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.77 
 
 		 613 aa  55.1  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0739  hypothetical protein  34.51 
 
 		 499 aa  54.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  32.73 
 
 		 592 aa  53.5  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 515 aa  53.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4653  histidine kinase  30.59 
 
 		 799 aa  53.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.688546 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  29.27 
 
 		 449 aa  53.1  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>