267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02250 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  100 
 
 		 991 aa  1984    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  43.74 
 
 		 818 aa  461  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  40.42 
 
 		 839 aa  449  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  35.48 
 
 		 836 aa  431  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  34.65 
 
 		 854 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  39.5 
 
 		 769 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  36.92 
 
 		 669 aa  360  9e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  36.19 
 
 		 805 aa  359  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  39.2 
 
 		 829 aa  355  2.9999999999999997e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  37.34 
 
 		 905 aa  353  1e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  37.72 
 
 		 763 aa  352  3e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  37.87 
 
 		 965 aa  348  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  36.7 
 
 		 683 aa  340  5.9999999999999996e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  37.14 
 
 		 801 aa  339  1.9999999999999998e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  36.02 
 
 		 637 aa  337  9e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  35.15 
 
 		 697 aa  334  4e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  35.55 
 
 		 841 aa  331  4e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 1132 aa  322  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  34.41 
 
 		 817 aa  318  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  36.29 
 
 		 807 aa  312  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  34.02 
 
 		 854 aa  310  8e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  34.35 
 
 		 795 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  33.86 
 
 		 821 aa  310  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  35.47 
 
 		 735 aa  302  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.16 
 
 		 1007 aa  301  5e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  34.94 
 
 		 843 aa  298  3e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  35.08 
 
 		 769 aa  291  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  31.77 
 
 		 1560 aa  290  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  35.62 
 
 		 687 aa  281  3e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  37.13 
 
 		 797 aa  280  9e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  34.3 
 
 		 973 aa  278  5e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  33.33 
 
 		 1026 aa  262  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  32.19 
 
 		 1281 aa  253  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  32.14 
 
 		 1023 aa  252  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.3 
 
 		 1282 aa  253  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  29.92 
 
 		 950 aa  248  6e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 1268 aa  241  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  32.09 
 
 		 1004 aa  236  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.44 
 
 		 1049 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  37.91 
 
 		 996 aa  232  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  39.83 
 
 		 1051 aa  231  5e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.6 
 
 		 957 aa  229  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 1182 aa  227  7e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 		 1119 aa  227  8e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  28.7 
 
 		 1164 aa  223  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  44.41 
 
 		 950 aa  222  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  42.42 
 
 		 1060 aa  219  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  40.69 
 
 		 974 aa  220  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  40.14 
 
 		 1077 aa  218  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  28.9 
 
 		 1148 aa  218  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  39.13 
 
 		 1092 aa  217  9e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 1034 aa  213  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  36.62 
 
 		 1022 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  30.02 
 
 		 1031 aa  202  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 		 860 aa  197  8.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  29.79 
 
 		 817 aa  196  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  35.56 
 
 		 1310 aa  196  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  30.05 
 
 		 879 aa  193  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  37.5 
 
 		 1402 aa  193  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  34.99 
 
 		 670 aa  192  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  38.74 
 
 		 1152 aa  190  9e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  38.82 
 
 		 516 aa  190  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 		 1435 aa  189  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  36.89 
 
 		 1000 aa  186  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.23 
 
 		 851 aa  183  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.23 
 
 		 851 aa  183  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.23 
 
 		 851 aa  183  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  29.5 
 
 		 814 aa  180  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  35.01 
 
 		 1076 aa  179  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  27.54 
 
 		 832 aa  174  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  35.89 
 
 		 876 aa  171  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  32.49 
 
 		 895 aa  170  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  42.47 
 
 		 436 aa  169  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 803 aa  168  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  36.96 
 
 		 863 aa  167  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  39.49 
 
 		 733 aa  166  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  35.2 
 
 		 839 aa  165  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  34.29 
 
 		 798 aa  166  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  38.66 
 
 		 769 aa  163  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  34.97 
 
 		 799 aa  161  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  31.79 
 
 		 794 aa  157  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  38.32 
 
 		 575 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  33.76 
 
 		 524 aa  140  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  34.88 
 
 		 465 aa  138  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 412 aa  138  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  34.7 
 
 		 832 aa  136  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  33.92 
 
 		 600 aa  133  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  31.97 
 
 		 764 aa  132  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  40 
 
 		 630 aa  130  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  37.67 
 
 		 484 aa  129  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 453 aa  128  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  37.17 
 
 		 485 aa  115  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  32.89 
 
 		 458 aa  110  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  32.2 
 
 		 539 aa  94.7  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  30.63 
 
 		 465 aa  62.4  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.854948 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0470  histidine kinase  30.32 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.53157 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 524 aa  60.8  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  34.38 
 
 		 438 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 448 aa  57.4  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 		 385 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>