120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3848 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  100 
 
 		 733 aa  1405    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  40.1 
 
 		 950 aa  234  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  42.58 
 
 		 1560 aa  234  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  41.75 
 
 		 817 aa  225  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.57 
 
 		 957 aa  217  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  39.73 
 
 		 1051 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  40.33 
 
 		 1402 aa  216  9.999999999999999e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  40.73 
 
 		 973 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  41.88 
 
 		 1310 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 1268 aa  212  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  41.53 
 
 		 1092 aa  208  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  39.76 
 
 		 974 aa  208  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  43.4 
 
 		 1152 aa  207  4e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  42.51 
 
 		 817 aa  207  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 		 1007 aa  206  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 860 aa  206  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  41.34 
 
 		 996 aa  206  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  40.99 
 
 		 1281 aa  203  7e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 		 1119 aa  203  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 		 1034 aa  202  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.09 
 
 		 1049 aa  201  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  38.44 
 
 		 769 aa  201  5e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  43.67 
 
 		 950 aa  200  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 		 1182 aa  200  9e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  41.54 
 
 		 1023 aa  198  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.07 
 
 		 1435 aa  196  9e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.22 
 
 		 851 aa  196  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.22 
 
 		 851 aa  196  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.22 
 
 		 851 aa  196  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  39.09 
 
 		 1004 aa  193  7e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  38.55 
 
 		 807 aa  193  8e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 1282 aa  192  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  38.55 
 
 		 1060 aa  193  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 		 1132 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  38.83 
 
 		 669 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  36.82 
 
 		 821 aa  191  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 		 1077 aa  189  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  42.46 
 
 		 697 aa  187  9e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  38.91 
 
 		 876 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  39.12 
 
 		 905 aa  184  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  37.61 
 
 		 797 aa  181  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  33.79 
 
 		 801 aa  179  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  36.47 
 
 		 879 aa  178  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  38.87 
 
 		 795 aa  177  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  33.81 
 
 		 1047 aa  177  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  40.13 
 
 		 637 aa  177  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 803 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.23 
 
 		 535 aa  176  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79817  normal  0.653673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  38.2 
 
 		 735 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  30.02 
 
 		 836 aa  173  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  34.26 
 
 		 1148 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  38.39 
 
 		 991 aa  172  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  41.1 
 
 		 1026 aa  172  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  36.89 
 
 		 1031 aa  171  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  33.87 
 
 		 1164 aa  170  7e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  42.47 
 
 		 854 aa  170  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  34.59 
 
 		 965 aa  168  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  36.19 
 
 		 1076 aa  167  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  33.95 
 
 		 895 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  32.81 
 
 		 1022 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  38.6 
 
 		 841 aa  164  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  37.68 
 
 		 769 aa  163  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  37.46 
 
 		 683 aa  163  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  35.94 
 
 		 854 aa  159  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  31.78 
 
 		 843 aa  158  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  34.33 
 
 		 818 aa  154  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  36.18 
 
 		 863 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  40.45 
 
 		 829 aa  152  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  37.36 
 
 		 687 aa  151  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  37.65 
 
 		 799 aa  151  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  39.37 
 
 		 763 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  33.51 
 
 		 794 aa  147  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  34 
 
 		 832 aa  147  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  34.4 
 
 		 814 aa  144  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  33.66 
 
 		 839 aa  144  9e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  34.57 
 
 		 805 aa  140  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  31.22 
 
 		 839 aa  139  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  36.05 
 
 		 1000 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  39.65 
 
 		 670 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  33.13 
 
 		 798 aa  134  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  39.09 
 
 		 832 aa  131  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  29.72 
 
 		 764 aa  131  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  45.51 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  37.5 
 
 		 769 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  38.86 
 
 		 575 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  36.41 
 
 		 484 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  29.5 
 
 		 516 aa  105  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  40.57 
 
 		 465 aa  99.4  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 412 aa  92.4  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.94 
 
 		 536 aa  91.7  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483396  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  34.87 
 
 		 600 aa  87.4  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 453 aa  85.5  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  35.9 
 
 		 539 aa  84.7  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  34.72 
 
 		 630 aa  82.4  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0359  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.01 
 
 		 542 aa  75.5  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  35.92 
 
 		 485 aa  71.6  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30950  methyl-accepting chemotaxis protein  32.61 
 
 		 540 aa  67.4  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.664181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 546 aa  66.6  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.09 
 
 		 538 aa  64.3  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  33.75 
 
 		 524 aa  63.9  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>