168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0757 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  100 
 
 		 798 aa  1543    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  72.59 
 
 		 839 aa  1071    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  34.93 
 
 		 1148 aa  276  8e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  34.72 
 
 		 1164 aa  274  6e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  30.52 
 
 		 794 aa  252  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  33.89 
 
 		 1031 aa  251  5e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  34.47 
 
 		 1022 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  32.08 
 
 		 832 aa  241  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  31.75 
 
 		 814 aa  241  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  33.23 
 
 		 863 aa  220  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 1119 aa  216  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  31.9 
 
 		 950 aa  210  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  29.74 
 
 		 1000 aa  209  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  31.16 
 
 		 1092 aa  208  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 		 1077 aa  206  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 1132 aa  206  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  31.89 
 
 		 1560 aa  206  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.07 
 
 		 957 aa  205  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 		 1007 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  32.39 
 
 		 973 aa  200  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  34.72 
 
 		 996 aa  197  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  30.97 
 
 		 1281 aa  196  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  31.06 
 
 		 1004 aa  196  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 1268 aa  194  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  29.32 
 
 		 879 aa  192  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 1182 aa  188  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  29.05 
 
 		 1047 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  33.74 
 
 		 950 aa  186  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  29.06 
 
 		 1051 aa  180  8e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.53 
 
 		 860 aa  180  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  28.31 
 
 		 836 aa  178  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  32.62 
 
 		 974 aa  177  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  31.15 
 
 		 817 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  35.97 
 
 		 1026 aa  174  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  38.11 
 
 		 841 aa  172  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  36.06 
 
 		 821 aa  172  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  34.86 
 
 		 801 aa  169  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 		 803 aa  168  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  35.89 
 
 		 669 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  34.29 
 
 		 991 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  31.2 
 
 		 764 aa  166  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  34.56 
 
 		 697 aa  165  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  27.89 
 
 		 1060 aa  164  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 		 1282 aa  164  7e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  32.89 
 
 		 905 aa  163  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  33.43 
 
 		 854 aa  161  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  28.66 
 
 		 817 aa  160  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  36.09 
 
 		 769 aa  159  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  29.85 
 
 		 683 aa  159  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  36 
 
 		 876 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  42.17 
 
 		 843 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.35 
 
 		 1049 aa  157  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 		 851 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 		 851 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 		 851 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 1435 aa  154  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  28.61 
 
 		 1023 aa  154  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  31.77 
 
 		 807 aa  152  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  35.39 
 
 		 1152 aa  152  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  35.31 
 
 		 839 aa  151  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  31.64 
 
 		 1402 aa  151  5e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  37.88 
 
 		 763 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  29.55 
 
 		 895 aa  150  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  36.48 
 
 		 637 aa  150  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  35.57 
 
 		 799 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 		 1034 aa  149  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  34.73 
 
 		 818 aa  148  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  36.23 
 
 		 854 aa  147  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  31.36 
 
 		 1310 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  29.02 
 
 		 795 aa  146  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  35.09 
 
 		 687 aa  144  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  39.2 
 
 		 829 aa  143  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  33.69 
 
 		 805 aa  138  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  33.33 
 
 		 797 aa  137  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  32.52 
 
 		 735 aa  134  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  36.84 
 
 		 965 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  33.33 
 
 		 733 aa  129  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  37.02 
 
 		 832 aa  125  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  32.08 
 
 		 1076 aa  124  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  37.44 
 
 		 575 aa  123  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  35.14 
 
 		 769 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  35 
 
 		 670 aa  116  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  32.82 
 
 		 769 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 412 aa  94.7  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  31.98 
 
 		 436 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  29.07 
 
 		 516 aa  91.3  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  31.01 
 
 		 484 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  25.08 
 
 		 600 aa  71.6  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  30.6 
 
 		 539 aa  71.6  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  27.62 
 
 		 630 aa  70.9  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  34.54 
 
 		 485 aa  68.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  25.91 
 
 		 465 aa  65.5  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  29.59 
 
 		 524 aa  63.9  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 		 453 aa  60.8  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  24.07 
 
 		 436 aa  60.1  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  23.51 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  23.15 
 
 		 438 aa  57  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 		 462 aa  56.2  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0149  osmolarity sensor protein  23.91 
 
 		 436 aa  56.2  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4018  osmolarity sensor protein  23.15 
 
 		 438 aa  55.8  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>