152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2844 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  100 
 
 		 794 aa  1574    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  44.96 
 
 		 832 aa  650    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  45.69 
 
 		 814 aa  619  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  38.72 
 
 		 764 aa  433  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  41.65 
 
 		 1000 aa  422  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  41.25 
 
 		 863 aa  420  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  33.83 
 
 		 1031 aa  325  3e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  35.08 
 
 		 1022 aa  314  4.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  34.96 
 
 		 1164 aa  310  9e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  34.22 
 
 		 1148 aa  300  1e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  30.41 
 
 		 1047 aa  265  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  32.76 
 
 		 839 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  31.48 
 
 		 798 aa  249  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 1007 aa  248  4e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  31.58 
 
 		 1281 aa  234  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 		 1077 aa  234  6e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 1119 aa  233  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  39.28 
 
 		 996 aa  226  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  31.09 
 
 		 973 aa  221  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 1132 aa  220  7.999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  36.12 
 
 		 1560 aa  220  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.01 
 
 		 1282 aa  219  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  30.42 
 
 		 950 aa  219  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.92 
 
 		 1049 aa  218  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  31.09 
 
 		 1092 aa  209  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 1268 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  29.8 
 
 		 905 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  29.65 
 
 		 807 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  32.7 
 
 		 974 aa  193  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  30.49 
 
 		 1060 aa  192  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  36.36 
 
 		 1004 aa  191  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.24 
 
 		 957 aa  191  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  30.38 
 
 		 1051 aa  188  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 1182 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  26.29 
 
 		 669 aa  185  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  29.06 
 
 		 797 aa  184  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  35.23 
 
 		 821 aa  181  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  27.77 
 
 		 683 aa  178  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  37.93 
 
 		 817 aa  179  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  28.59 
 
 		 769 aa  179  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 		 860 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  37.79 
 
 		 879 aa  171  6e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  33.83 
 
 		 895 aa  169  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  36.54 
 
 		 801 aa  168  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  39.46 
 
 		 950 aa  167  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  35.05 
 
 		 836 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  27.41 
 
 		 854 aa  165  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 803 aa  165  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 		 851 aa  165  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 		 851 aa  165  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  34.99 
 
 		 697 aa  165  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 		 851 aa  165  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  29.23 
 
 		 637 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  26.37 
 
 		 735 aa  164  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 1435 aa  161  5e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  33.33 
 
 		 1402 aa  161  5e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  33.84 
 
 		 1310 aa  160  8e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  30.54 
 
 		 1152 aa  159  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  32.21 
 
 		 817 aa  158  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 1034 aa  158  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  34.47 
 
 		 1023 aa  157  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  31.79 
 
 		 991 aa  157  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  33.96 
 
 		 841 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  28.28 
 
 		 1026 aa  155  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  35.65 
 
 		 876 aa  153  8.999999999999999e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  27.33 
 
 		 795 aa  151  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  35.75 
 
 		 687 aa  151  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  26.04 
 
 		 854 aa  151  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  36.72 
 
 		 799 aa  148  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  30.79 
 
 		 818 aa  148  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  35.03 
 
 		 769 aa  146  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  27.17 
 
 		 805 aa  144  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  33.14 
 
 		 829 aa  143  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  35.63 
 
 		 1076 aa  143  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  37.09 
 
 		 965 aa  141  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  31.56 
 
 		 839 aa  141  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  34.94 
 
 		 733 aa  139  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  34.26 
 
 		 763 aa  135  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  34.15 
 
 		 843 aa  135  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  36.24 
 
 		 575 aa  120  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  34.7 
 
 		 832 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  33.21 
 
 		 516 aa  104  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  31.48 
 
 		 670 aa  103  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  29.27 
 
 		 436 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 412 aa  97.8  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  36.9 
 
 		 485 aa  94.7  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  33 
 
 		 769 aa  90.9  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  27.45 
 
 		 484 aa  84.3  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  32.38 
 
 		 600 aa  78.2  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  27.87 
 
 		 524 aa  75.5  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  30.17 
 
 		 458 aa  73.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 453 aa  73.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  33.33 
 
 		 465 aa  72  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  29.09 
 
 		 630 aa  71.6  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  31.48 
 
 		 539 aa  62.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.38 
 
 		 1174 aa  55.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  19.01 
 
 		 720 aa  55.1  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0087  histidine kinase  23.98 
 
 		 369 aa  54.7  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00115186  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0265  sensor histidine kinase  29.76 
 
 		 697 aa  53.5  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.38 
 
 		 1167 aa  53.9  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>