180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5599 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  100 
 
 		 764 aa  1511    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  38.72 
 
 		 794 aa  429  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  36.55 
 
 		 832 aa  429  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  36.28 
 
 		 814 aa  405  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  36.46 
 
 		 1047 aa  363  5.0000000000000005e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  36.72 
 
 		 1000 aa  303  9e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  32.62 
 
 		 863 aa  289  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  34.55 
 
 		 1148 aa  281  4e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  34.47 
 
 		 1164 aa  264  6e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  33.28 
 
 		 1031 aa  244  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  40.51 
 
 		 1022 aa  223  8e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  29.22 
 
 		 1092 aa  213  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  29.85 
 
 		 1281 aa  211  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  37.57 
 
 		 996 aa  208  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  30.24 
 
 		 973 aa  205  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 1007 aa  201  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 1119 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 		 1132 aa  201  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 1282 aa  201  6e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  38.89 
 
 		 1560 aa  199  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  28.73 
 
 		 1051 aa  192  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 		 1077 aa  191  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  31.08 
 
 		 879 aa  189  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 		 1268 aa  183  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  37.17 
 
 		 1060 aa  182  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  28.77 
 
 		 950 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 860 aa  180  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  29.57 
 
 		 797 aa  179  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.91 
 
 		 1049 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.1 
 
 		 957 aa  177  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  35.63 
 
 		 807 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 1182 aa  176  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  33.24 
 
 		 669 aa  173  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  35.89 
 
 		 1402 aa  171  6e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  35.76 
 
 		 1004 aa  169  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  34.93 
 
 		 1310 aa  169  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  38.36 
 
 		 950 aa  167  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 803 aa  165  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  27.99 
 
 		 1023 aa  164  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  30.87 
 
 		 817 aa  164  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 851 aa  163  9e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 851 aa  163  9e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 851 aa  163  9e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  33.07 
 
 		 974 aa  163  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  30.18 
 
 		 798 aa  162  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  34.58 
 
 		 697 aa  159  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  35.46 
 
 		 769 aa  158  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  34.44 
 
 		 637 aa  158  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  35.31 
 
 		 876 aa  158  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  33.53 
 
 		 683 aa  157  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  32.64 
 
 		 905 aa  156  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  30.51 
 
 		 839 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  29.63 
 
 		 735 aa  154  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  30.55 
 
 		 1152 aa  154  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  34.53 
 
 		 801 aa  148  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  26.89 
 
 		 854 aa  147  9e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 1034 aa  144  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  35.25 
 
 		 895 aa  143  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  37.4 
 
 		 1076 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  26.04 
 
 		 821 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  32.76 
 
 		 1026 aa  140  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  37.26 
 
 		 965 aa  139  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  32.89 
 
 		 836 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 1435 aa  138  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  33.33 
 
 		 817 aa  138  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  32.05 
 
 		 818 aa  138  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  35.8 
 
 		 687 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  32.1 
 
 		 854 aa  135  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  34.51 
 
 		 841 aa  134  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  31.97 
 
 		 991 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  35.46 
 
 		 805 aa  131  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  29.39 
 
 		 769 aa  130  8.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  37.65 
 
 		 799 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  32.03 
 
 		 839 aa  125  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  35.69 
 
 		 829 aa  125  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  33.89 
 
 		 763 aa  124  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  35.59 
 
 		 670 aa  118  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  31.51 
 
 		 733 aa  118  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  28.47 
 
 		 795 aa  118  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  33.33 
 
 		 843 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  35.78 
 
 		 575 aa  110  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  34.72 
 
 		 832 aa  110  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  33.86 
 
 		 516 aa  108  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  35.91 
 
 		 436 aa  104  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  37 
 
 		 769 aa  101  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  39.88 
 
 		 412 aa  99.8  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  35.65 
 
 		 484 aa  96.3  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  36.57 
 
 		 485 aa  94  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  34.11 
 
 		 630 aa  88.2  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  31.98 
 
 		 600 aa  82.8  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  30.39 
 
 		 465 aa  76.6  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  28.86 
 
 		 524 aa  75.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  33.72 
 
 		 539 aa  73.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 453 aa  72  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  27.39 
 
 		 458 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0861  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 384 aa  55.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.339041  normal  0.260174 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 587 aa  54.7  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.773486  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0755  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 588 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.452305  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0806  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 587 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2195  sensor histidine kinase  25.73 
 
 		 452 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00104327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>