139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3805 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  100 
 
 		 821 aa  1619    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  46.45 
 
 		 817 aa  598  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  46.01 
 
 		 801 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  47.7 
 
 		 769 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  40.22 
 
 		 697 aa  428  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  36.72 
 
 		 807 aa  420  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  39.13 
 
 		 841 aa  418  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  35.06 
 
 		 905 aa  419  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  37.4 
 
 		 843 aa  411  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  36.99 
 
 		 797 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  39.22 
 
 		 669 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  36.93 
 
 		 637 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  38.44 
 
 		 683 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  36.37 
 
 		 854 aa  366  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  37.9 
 
 		 735 aa  365  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  33.02 
 
 		 836 aa  359  9.999999999999999e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 1132 aa  348  3e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 		 1007 aa  343  5.999999999999999e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  32.62 
 
 		 839 aa  340  5e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  32.31 
 
 		 854 aa  333  8e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  35.14 
 
 		 795 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  34.07 
 
 		 763 aa  326  1e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  34.31 
 
 		 818 aa  315  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  33.86 
 
 		 991 aa  309  1.0000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  32.27 
 
 		 829 aa  299  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  33.85 
 
 		 965 aa  295  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  35.26 
 
 		 950 aa  294  5e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  34.75 
 
 		 769 aa  282  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  33.5 
 
 		 1560 aa  276  8e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  33.11 
 
 		 805 aa  274  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  31.66 
 
 		 973 aa  273  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  34.04 
 
 		 687 aa  272  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  33.39 
 
 		 1281 aa  271  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.39 
 
 		 957 aa  265  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 1282 aa  262  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 1268 aa  258  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.75 
 
 		 1049 aa  256  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  31.64 
 
 		 1051 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  33.7 
 
 		 1026 aa  249  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  32.06 
 
 		 817 aa  249  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  32.97 
 
 		 950 aa  247  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 1119 aa  246  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  32.05 
 
 		 1004 aa  244  7e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 		 1077 aa  240  5.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  30.37 
 
 		 974 aa  240  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 1182 aa  239  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  30.79 
 
 		 1092 aa  235  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  28.61 
 
 		 996 aa  229  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  30.78 
 
 		 1031 aa  228  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  37.4 
 
 		 1023 aa  226  9e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  29.33 
 
 		 879 aa  223  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  29.68 
 
 		 1060 aa  214  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  29.94 
 
 		 1022 aa  211  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  32.53 
 
 		 1152 aa  207  5e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  27.96 
 
 		 1402 aa  206  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  30.03 
 
 		 1148 aa  204  7e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  29.24 
 
 		 1164 aa  203  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 1034 aa  203  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  37.39 
 
 		 670 aa  201  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 		 1435 aa  200  7.999999999999999e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  33.69 
 
 		 1310 aa  196  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  29.2 
 
 		 1000 aa  195  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  29.04 
 
 		 895 aa  191  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 860 aa  191  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  35.19 
 
 		 1047 aa  188  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 851 aa  183  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 851 aa  183  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 851 aa  183  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  35.23 
 
 		 794 aa  181  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  37.21 
 
 		 1076 aa  180  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  31.3 
 
 		 863 aa  180  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  40.52 
 
 		 733 aa  179  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  28.01 
 
 		 832 aa  175  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  36.06 
 
 		 798 aa  172  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  34.39 
 
 		 876 aa  170  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  36.34 
 
 		 799 aa  168  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  28.18 
 
 		 814 aa  164  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  34.38 
 
 		 839 aa  160  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  32.67 
 
 		 516 aa  159  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  36.07 
 
 		 436 aa  147  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  38.61 
 
 		 769 aa  145  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  26.04 
 
 		 764 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  31.83 
 
 		 484 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  39.81 
 
 		 575 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  34.23 
 
 		 832 aa  128  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 412 aa  126  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  29.51 
 
 		 465 aa  121  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  33.21 
 
 		 600 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  32.01 
 
 		 524 aa  118  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 		 453 aa  117  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  31.91 
 
 		 458 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  36.42 
 
 		 539 aa  109  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  31.71 
 
 		 630 aa  107  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  36.72 
 
 		 485 aa  104  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2282  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.73 
 
 		 664 aa  60.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.330304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0664  ANTAR domain protein with unknown sensor  25.5 
 
 		 441 aa  57.4  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.293281  normal  0.015345 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 417 aa  54.7  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0444  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.31 
 
 		 613 aa  53.1  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0364501  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5712  histidine kinase  30 
 
 		 483 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1929  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.34 
 
 		 662 aa  52.4  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23754  normal  0.0188929 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>