185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2444 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  100 
 
 		 836 aa  1688    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  48.37 
 
 		 854 aa  739    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  37.6 
 
 		 839 aa  474  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  37.48 
 
 		 991 aa  429  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  40.19 
 
 		 818 aa  429  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  36.65 
 
 		 829 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  35.1 
 
 		 769 aa  379  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  38.12 
 
 		 763 aa  361  4e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  33.02 
 
 		 821 aa  359  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  32.93 
 
 		 801 aa  352  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  31.8 
 
 		 817 aa  349  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  37.23 
 
 		 965 aa  348  3e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  31.35 
 
 		 854 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 1132 aa  337  5e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  34.12 
 
 		 683 aa  332  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  34.8 
 
 		 697 aa  331  4e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  33.45 
 
 		 807 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  33.29 
 
 		 905 aa  324  4e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  31.7 
 
 		 843 aa  322  1.9999999999999998e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  34.46 
 
 		 795 aa  321  3.9999999999999996e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  35.32 
 
 		 669 aa  320  7.999999999999999e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  34.5 
 
 		 637 aa  317  7e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  33.48 
 
 		 841 aa  313  6.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.41 
 
 		 1007 aa  312  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  32.34 
 
 		 797 aa  309  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  31.61 
 
 		 805 aa  297  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  35.44 
 
 		 687 aa  294  4e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  40.68 
 
 		 1560 aa  278  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  39.74 
 
 		 1281 aa  275  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  45.76 
 
 		 735 aa  273  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  44.74 
 
 		 973 aa  273  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.65 
 
 		 1282 aa  272  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  32.68 
 
 		 950 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 1077 aa  267  5e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  33.53 
 
 		 769 aa  266  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 		 1119 aa  262  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.41 
 
 		 957 aa  258  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  42 
 
 		 1026 aa  256  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  43.47 
 
 		 1004 aa  254  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  30.99 
 
 		 1092 aa  252  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.95 
 
 		 1049 aa  248  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.49 
 
 		 1268 aa  248  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  45.66 
 
 		 1051 aa  247  6e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  31.97 
 
 		 950 aa  246  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  39.95 
 
 		 996 aa  244  6e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  38.25 
 
 		 974 aa  240  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  44.55 
 
 		 1060 aa  238  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  31.98 
 
 		 1031 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  29.09 
 
 		 817 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  40.11 
 
 		 670 aa  231  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  28.66 
 
 		 1164 aa  229  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  28.84 
 
 		 1148 aa  224  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  30.05 
 
 		 1023 aa  224  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 		 1182 aa  220  7e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  42.77 
 
 		 1022 aa  219  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  40.92 
 
 		 879 aa  211  4e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  37.2 
 
 		 1152 aa  209  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  32.85 
 
 		 1047 aa  207  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  37.33 
 
 		 1310 aa  205  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  37.21 
 
 		 1402 aa  199  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  38.11 
 
 		 516 aa  194  6e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 		 1034 aa  194  6e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  36.5 
 
 		 863 aa  189  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 1435 aa  188  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 		 860 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  32.93 
 
 		 1000 aa  183  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  31.69 
 
 		 895 aa  182  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  31.79 
 
 		 832 aa  182  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  44.29 
 
 		 769 aa  178  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  28.31 
 
 		 798 aa  178  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 		 851 aa  175  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 		 851 aa  175  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 		 851 aa  175  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  35.05 
 
 		 794 aa  165  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 		 803 aa  164  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  31.39 
 
 		 839 aa  161  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 412 aa  162  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  34.97 
 
 		 799 aa  160  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  40 
 
 		 436 aa  160  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  36.09 
 
 		 876 aa  159  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  30.31 
 
 		 814 aa  157  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  35.33 
 
 		 484 aa  156  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  36.29 
 
 		 1076 aa  155  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  34.54 
 
 		 733 aa  152  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  37.1 
 
 		 832 aa  147  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  40.47 
 
 		 630 aa  145  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  34.81 
 
 		 600 aa  143  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  39.89 
 
 		 465 aa  142  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  32.89 
 
 		 764 aa  139  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  37.97 
 
 		 524 aa  137  9e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  36.43 
 
 		 575 aa  136  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 453 aa  128  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  33.08 
 
 		 485 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  35.61 
 
 		 539 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  32.2 
 
 		 458 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 464 aa  60.5  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0367152  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5712  histidine kinase  34.82 
 
 		 483 aa  58.9  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0498  histidine kinase  24.67 
 
 		 391 aa  55.1  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  26.2 
 
 		 465 aa  54.7  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.854948 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 462 aa  53.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>