210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3599 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  100 
 
 		 841 aa  1623    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  76.71 
 
 		 843 aa  1152    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  37.05 
 
 		 905 aa  462  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  39.5 
 
 		 821 aa  459  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  43.06 
 
 		 769 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  37.44 
 
 		 817 aa  439  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  36.73 
 
 		 801 aa  424  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  38.47 
 
 		 683 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  37.38 
 
 		 669 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  39.62 
 
 		 697 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  35.12 
 
 		 807 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  39.06 
 
 		 735 aa  391  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  38.28 
 
 		 637 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  35.93 
 
 		 854 aa  379  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  38.4 
 
 		 797 aa  352  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  34.32 
 
 		 839 aa  350  5e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  34.33 
 
 		 991 aa  338  2.9999999999999997e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  37.78 
 
 		 763 aa  337  5e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  32.48 
 
 		 836 aa  337  5.999999999999999e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  37.34 
 
 		 818 aa  332  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 1132 aa  332  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  34.3 
 
 		 854 aa  328  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  35.08 
 
 		 795 aa  319  2e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  35.03 
 
 		 769 aa  315  2.9999999999999996e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  34.91 
 
 		 829 aa  309  2.0000000000000002e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 1007 aa  297  4e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  34.26 
 
 		 965 aa  294  5e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  34.56 
 
 		 950 aa  283  8.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  32.78 
 
 		 805 aa  280  9e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  46.88 
 
 		 1560 aa  273  7e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  35.01 
 
 		 1092 aa  272  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 1119 aa  271  4e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  33.07 
 
 		 1281 aa  270  8e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 1077 aa  270  8.999999999999999e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  32.93 
 
 		 950 aa  269  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 1282 aa  265  4e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  34.48 
 
 		 687 aa  264  4.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.91 
 
 		 957 aa  257  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  34.42 
 
 		 1023 aa  255  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  34.39 
 
 		 973 aa  252  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.71 
 
 		 1049 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  39.39 
 
 		 1051 aa  248  4e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  31.87 
 
 		 1004 aa  247  6.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 1268 aa  246  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  33.39 
 
 		 996 aa  244  3.9999999999999997e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  33.23 
 
 		 1031 aa  243  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  33.94 
 
 		 1022 aa  241  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  31.09 
 
 		 974 aa  240  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 1182 aa  238  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  32.76 
 
 		 1148 aa  238  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  30.46 
 
 		 817 aa  238  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  29.7 
 
 		 879 aa  233  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  32.87 
 
 		 1026 aa  233  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  30.93 
 
 		 1164 aa  230  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  30.76 
 
 		 1060 aa  226  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  30.92 
 
 		 1047 aa  214  7.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  33.33 
 
 		 1152 aa  207  7e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 1034 aa  206  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  39.58 
 
 		 670 aa  205  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  39.5 
 
 		 1402 aa  204  8e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  38.92 
 
 		 1310 aa  200  9e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 		 1435 aa  193  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 		 851 aa  189  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 		 851 aa  189  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 		 860 aa  189  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 		 851 aa  189  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  30.54 
 
 		 839 aa  188  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  37.69 
 
 		 876 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  29.44 
 
 		 1000 aa  181  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  40.51 
 
 		 799 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  33.98 
 
 		 863 aa  176  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  30.12 
 
 		 798 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 803 aa  174  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  35.24 
 
 		 516 aa  170  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  35.25 
 
 		 895 aa  169  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  38.21 
 
 		 1076 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  32.29 
 
 		 832 aa  161  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  38.6 
 
 		 733 aa  160  9e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  28.26 
 
 		 794 aa  159  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  33.82 
 
 		 814 aa  154  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  39.63 
 
 		 436 aa  151  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  40.45 
 
 		 575 aa  151  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  39.39 
 
 		 769 aa  150  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  30.48 
 
 		 764 aa  138  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  40.28 
 
 		 484 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  34.4 
 
 		 832 aa  135  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 412 aa  130  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  32.63 
 
 		 600 aa  121  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  33.33 
 
 		 630 aa  120  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 453 aa  118  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  31.52 
 
 		 465 aa  118  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  33.33 
 
 		 524 aa  111  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  37.44 
 
 		 539 aa  107  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  37.5 
 
 		 485 aa  107  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  31.79 
 
 		 458 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0586  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 477 aa  58.5  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0247  ATPase domain-containing protein  37.5 
 
 		 628 aa  58.5  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  28.64 
 
 		 477 aa  56.6  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1929  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.56 
 
 		 662 aa  55.5  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23754  normal  0.0188929 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 515 aa  54.7  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>